|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ИНХС РАН |
||
Comparative analysis of Illumina and Ion Torrent high-throughput sequencing platforms for identification of plant components in herbal teasстатья
Статья опубликована в высокорейтинговом журнале
Информация о цитировании статьи получена из
Web of Science,
Scopus
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 2 октября 2018 г.
- Авторы: Speranskaya Anna S., Khafizov Kamil, Ayginin Andrey A., Krinitsina Anastasia A., Omelchenko Denis O., Nilova Maya V., Severova Elena E., Samokhina Evgeniya N., Shipulin German A., Logacheva Maria D.
- Журнал: Food Control
- Том: 93
- Год издания: 2018
- Издательство: Elsevier BV
- Местоположение издательства: Netherlands
- Первая страница: 315
- Последняя страница: 324
- DOI: 10.1016/j.foodcont.2018.04.040
- Аннотация: The rapid development of high-throughput sequencing (HTS) methods offers new opportunities for foodquality control and identification of food components using the DNA barcoding approach (meta-barcoding in cases of complex mixes). However, the protocols of DNA barcoding applied to food analysisare not yet fully established; testing and optimization are required to achieve the highes t accuracy andcost efficiency. We report here a comparative study of the two most widely used sequencing platforms -Illumina and Ion Torrent - for composition analysis of herbal teas, and show that both technologies yieldcongruent results, both qualitatively and quantitatively. They have revealed the substitution of fireweed(Epilobium angustifolium L.) by Lythrum sp. in one of the samples. It was confirmed by classic methods ofbotanical analysis (anatomy and palynology). In most samples, undeclared components have beendetected, such as bindweed (Convolvulus) and ragweed (Ambrosia), which are known toxic and allergy-causing plants.
- Добавил в систему: Сперанская Анна Сергеевна
Прикрепленные файлы
| № | Имя | Описание | Имя файла | Размер | Добавлен |
|---|---|---|---|---|---|
| 1. | Полный текст | 1-s2.0-S0956713518302032-main.pdf | 911,7 КБ | 28 августа 2018 [Speranskaya_Anna] |