Мутанты флуоресцентного белка mRFP1 по остатку 66: моделирование структур методом молекулярной динамики и поиск корреляций с оптическими свойствами

Храмеева, Е.Е.; Друца, В.Л.; Вржещ, Е.П.; Дмитриенко, Д.В.; Вржещ, П.В.

Авторы: Храмеева Е.Е., Друца В.Л., Вржещ Е.П., Дмитриенко Д.В., Вржещ П.В.
Журнал: Биохимия
Том: 73
Номер: 10
Год издания: 2008
Издательство: ФГБУ "Издательство "Наука"
Местоположение издательства: Москва
Первая страница: 1355
Последняя страница: 1367
Аннотация: С целью исследования связи между оптическими свойствами флуоресцентных белков и их структурой проведено молекулярно-динамическое моделирование структур мутантных белков на основе мономерного красного флуоресцентного белка mRFP1 со всеми возможными единичными точечными аминокислотными заменами остатка Glu-66 (кроме замены на Pro). Для хромофоров и их окружения (6Å) в белке дикого типа, Q66A, Q66L, Q66S, Q66C, Q66H и Q66N был осуществлен глобальный поиск корреляций геометрических параметров структур с определенными нами оптическими свойствами (длина волны в максимуме поглощения, интегральный коэффициент экстинкции в максимуме поглощения, длина волны в максимуме возбуждения флуоресценции, длина волны в максимуме эмиссии флуоресценции и квантовый выход флуоресценции). Наиболее высокие коэффициенты корреляции (0,81–0,87) обнаружены для торсионных углов фенольного и имидазолидонового колец, а также располагающихся в областях присоединения фенольного кольца к имидазолидоновому кольцу и хромофора к бета-баррелю. Найденные корреляции позволят прогнозировать оптические свойства флуоресцентных белков на основании их структур, а также выделять позиции, наиболее важные для направленного мутагенеза.
Добавил в систему: Друца Валерий Львович

	ИСТИНА	Войти в систему Регистрация
	ИСТИНА ИНХС РАН
	Главная Поиск Статистика О проекте Помощь

ИСТИНА

ИСТИНА ИНХС РАН

Мутанты флуоресцентного белка mRFP1 по остатку 66: моделирование структур методом молекулярной динамики и поиск корреляций с оптическими свойствамистатья

Прикрепленные файлы