Поиск факторов репликации HIV‑1 и HTLV ‑1 с помощью скрининга библиотеки нокаутов GeCKOстатьяТезисы
Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Статья опубликована в журнале из перечня ВАК
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 21 мая 2019 г.
Аннотация:Вирус иммунодефицита (HIV‑1) и Т-лимфотропный вирус первого типа (HTLV‑1) относятся к патогенным ретровирусам человека. HIV‑1 заражает преимущественно CD4 Т-лимфоциты и является причиной синдрома приобретенного иммунодефицита человека (СПИДа). HTLV‑1 заражает CD4 и CD8 Т-лимфоциты и вызывает развитие острого Т-клеточного лейкоза и воспалительный аутоиммунно-дегенеративный процесс в спинном мозге. Репликация обоих ретровирусов зависит от множества клеточных белков, в совокупности называемых факторами репликации. В отличие от факторов рестрикции, факторы репликации обеспечивают пермиссивность клетки для размножения вируса. Мы разработали метод поиска факторов репликации HIV‑1 и HTLV‑1 с помощью библиотеки нокаутов GeCKO на основе CRISPR/Cas9 технологии редактирования генома. Каждая клетка библиотеки содержит нокаут в одном из 18080 генов. При заражении библиотеки вирусами HIV‑1 и HTLV‑1 удалось выявить устойчивые к инфекции популяции клеток. В результате глубокого секвенирования и последующего анализа были выявлены гены-кандидаты факторов репликации данных ретровирусов.