Внутривидовой полиморфизм штаммов GANODERMA LUCIDUM Сборник трудов 5-ой Международной конференции «Изучение грибов в биогеоценозах». Пермьтезисы доклада
Аннотация:Ganoderma lucidum является комплексным видом, объединяя внутривидовые группы, филогенетическая концепция которых до сих пор не разработана (Moncalvo et al., 1995; Zmitrovich et al., 2006). Значительные трудности при описании штаммов данного вида гриба по морфологии и культуральным свойствам вызывает их высокая степень вариабельности в зависимости от условий культивирования.В настоящей работе предпринята попытка анализа штаммов G. lucidum из коллекции кафедры микологии и альгологии биологического факультета МГУ с применением, наряду с классическими методами микологии, биохимических и генетических методов исследования. Такой подход особенно важен, когда речь идет о трудно идентифицируемых видах, видах-двойниках и видах с нечеткими морфологическими границами.
Был использован метод РАПД-ПЦР, чувствительность которого отвечает требованиям исследований, касающихся изменчивости внутри вида G. lucidum. РАПД-полиморфизм нашей выборки был исследован с использованием десятичленных олигонуклеотидных праймеров, уже продемонстрировавших свою эффективность на большой группе грибов, относящихся к роду Ganoderma. В ходе работы была обнаружена высокая степень молекулярного полиморфизма исследуемой выборки.При сравнении молекулярных профилей (паттернов амплификации) обнаружен фрагмент размером 620 п.н. (пар нуклеотидов), проявляющийся только у штаммов G. lucidum. В составе РАПД-спектров штаммов Исследование изменчивости штаммов G. lucidum с помощью разных методов позволило сопоставить полученные результаты (см. табл.). Была получена индивидуальная характеристика для каждой РАПД-группы, отличавшейся географическим происхождением и высокой степенью гомогенности (однородности) по выбранным маркерам. Обнаруженные внутривидовые группы штаммов с индивидуальными характеристиками по набору признаков, должны быть учтены при рассмотрении объема и таксономического статуса сложного вида G. lucidum. Благодаря использованному набору РАПД-праймеров, уже применявшихся для анализа рода Gаnoderma, появилась возможность в будущем сравнить молекулярные фенотипы штаммов нашей выборки и мировой коллекции.