Аннотация:В статье проанализированы перспективы реализации многоуровневых территориальных инновационных проектов на мезоуровне в зависимости от общего состояния региональной социально-экономической системы. Выбраны определяющие функции поддержки инновационной устойчивости (институциональная, прогностическая, регулирующая, проектная, протекционистская и антикризисная), а также определены последовательные и временные промежутки реализации федеральной Стратегии инновационного развития России до 2020 года на мезоуровне.