Ингибирование интегразы ВИЧ-1 димерными бисбензимидазолами с различной структурой линкерастатья
Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Информация о цитировании статьи получена из
Scopus
Статья опубликована в журнале из перечня ВАК
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 25 апреля 2017 г.
Аннотация:Интеграза ВИЧ-1 осуществляет одну из ключевых стадий репликативного цикла вируса – встраивание ДНК копии геномной РНК в геном инфицированной клетки. Ингибирование интеграции приводит к подавлению репликации вируса. В настоящей работе изучено ингибирование интеграции димерными бисбензимидазолами DBBI(7) с гептаметиленовым и DBBI(8) с триэтиленгликолевым линкером и установлено, что для DBBI(7) Концентрация ингибитора, при которой наблюдается 50%-ное ингибирование ферментативной реакции, составляет порядка 0.03 мкМ, а для DBBI(8) – 10 мкМ. С использованием метода кросс-линкинга показано, что оба соединения препятствуют правильной укладке ДНК-субстрата в активном центре интегразы. С целью выяснения механизма ингибирования определены константы диссоциации комплексов DBBI с ДНК-субстратом интегразы. Значения Kd для комплексов с DBBI(7) и с DBBI(8) равны 270 и 140 нМ, соответственно. Таким образом, ингибирование интеграции непосредственно не вызвано связыванием DBBI с ДНК. Найдена зависимость начальной скорости ферментативной реакции от концентрации ДНК-субстрата при различных концентрациях ингибитора и определены константы ингибирования. На основании полученных результатов сделан вывод о том, что разная ингибирующая активность DBBI(7) и DBBI(8) обусловлена различным механизмом их действия: DBBI(7) – конкурентным ингибитором интегразы, в то время как для DBBI(8) предположен смешанный механизм ингибирования