The Effect of Cell Metabolism on Biomass Yield during the Growth on Various Substrates. Компьютерные исследования и моделирование. Т. 9. № 6. С. 993−1014.http://crm.ics.org.ru/uploads/crmissues/crm_2017_6/2017_06_11.pdfстатья
Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Информация о цитировании статьи получена из
Scopus
Статья опубликована в журнале из перечня ВАК
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 1 апреля 2020 г.
Аннотация:Рассмотрены биоэнергетические закономерности, определяющие максимальный выход биомассы при аэробном росте микроорганизмов на различных субстратах. Подход основан на методе материально-энергетического баланса и использовании пакета компьютерных программ GenMetPath. Сформулирова-на система уравнений, описывающих балансы количеств 1) восстановленности метаболитов и 2) образо-ванных и затраченных макроэргических связей. Чтобы сформулировать эту систему, целостный метабо-лизм разделен на конструктивный и энергетический парциальные обмены. Конструктивный обмен, в свою очередь, разделен на две части: передний и стандартный конструктивные обмены. Последнее раз-деление основано на выборе узловых метаболитов. Передний конструктивный обмен существенно зави-сит от субстрата роста: он превращает субстрат в стандартный набор узловых метаболитов. Последний, затем, превращается в макромолекулы биомассы стандартным конструктивным обменом, который оди-наков на различных субстратах. Показано, что вариации потоков через узловые метаболиты оказывают незначительное влияние на стандартный конструктивный обмен. Как отдельный случай, рассмотрен рост на субстратах требующих участия оксигеназ и/или оксидаз. Биоэнергетические характеристики стандартного конструктивного обмена найдены из большого числа данных для роста различных орга-низмов на глюкозе. Описанный подход может быть использован для предсказания выхода биомассы на субстратах с известными реакциями их первичной метаболизации. В качестве примера рассмотрен рост культуры дрожжей на этаноле. Значение максимального выхода, предсказанное описанным здесь методом, показало хорошее соответствие значению, найденному экспериментально.