Механохимическое расщепление ДНК как инструмент анализа функциональных участков геномастатья

Работа с статьей


[1] Механохимическое расщепление ДНК как инструмент анализа функциональных участков генома / И. А. Ильичева, Л. А. Панченко, Л. А. Урошлев и др. // Обозрение прикладной и промышленной математики. — 2019. — Т. 26, № 4. — С. 254–262. Позиции разрывов межнуклеотидных связей считали случайными, не зависящими от последовательности нуклеотидов. Поэтому ультразвук широко использовали в методиках NGS-секвенирования геномных ДНК. С.Л. Гроховский предпринял более детальные исследования процессов ультразвукового расщепления ДНК [7]. Оказалось, что ультразвуковая фрагментация ДНК происходит не случайным образом, а специфично к последовательности нуклеотидов. На интенсивность ультразвукового расщепления межнуклеотидной связи влияет как тип динуклеотида, так и его соседи (нуклеотидный контекст). О причине этого явления в работе [9] мы смогли высказать предположение после того, как провели детальный анализ имеющихся в литературе ЯМР-исследований конформационного поведения малых фрагментов ДНК, а также многочисленных рентгеноструктурных работ и конформационных расчетов. Итак, с уверенностью можно сказать, что нуклеотидная последовательность в промоторных областях геномов характеризуется такими свойствами, которые способствуют перестройкам пространственной структуры двойной спирали при связывании регуляторных белков и облегчают последующее формирование так называемого открытого комплекса, необходимого для транскрипции.

Публикация в формате сохранить в файл сохранить в файл сохранить в файл сохранить в файл сохранить в файл сохранить в файл скрыть