|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ИНХС РАН |
||
Studying RNA-DNA interactome by Red-C identifies noncoding RNAs associated with various chromatin types and reveals transcription dynamicsстатья Исследовательская статья
Статья опубликована в высокорейтинговом журнале
Информация о цитировании статьи получена из
Web of Science,
Scopus
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 1 декабря 2021 г.
- Авторы: Gavrilov AA, Zharikova AA, Galitsyna AA, Luzhin AV, Rubanova NM, Golov AK, Petrova NV, Logacheva MD, Kantidze OL, Ulianov SV, Magnitov MD, Mironov AA, Razin SV
- Журнал: Nucleic Acids Research
- Том: 48
- Номер: 12
- Год издания: 2020
- Издательство: Oxford University Press
- Местоположение издательства: United Kingdom
- Первая страница: 6699
- Последняя страница: 6714
- DOI: 10.1093/nar/gkaa457
- Аннотация: Non-coding RNAs (ncRNAs) participate in various biological processes, including regulating transcription and sustaining genome 3D organization. Here, we present a method termed Red-C that exploits proximity ligation to identify contacts with the genome for all RNA molecules present in the nucleus. Using Red-C, we uncovered the RNA–DNA interactome of human K562 cells and identified hundreds of ncRNAs enriched in active or repressed chromatin, including previously undescribed RNAs. Analysis of the RNA–DNA interactome also allowed us to trace the kinetics of messenger RNA production. Our data support the model of co-transcriptional intron splicing, but not the hypothesis of the circularization of actively transcribed genes.
- Добавил в систему: Разин Сергей Владимирович
Прикрепленные файлы
| № | Имя | Описание | Имя файла | Размер | Добавлен |
|---|---|---|---|---|---|
| 1. | Полный текст | gkaa457.pdf | 3,9 МБ | 2 июня 2020 [sergey.v.razin] |