|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ИНХС РАН |
||
Промотор T7 бактериофага: связь специфичности и последовательности опосредована физикой дуплекса ДНК?тезисы доклада
- Авторы: Орлов М.А., Джелядин Т.Р., Сорокин А.А.
- Сборник: Гены и Клетки - материалы VII МОЛОДЁЖНОЙ ШКОЛЫ-КОНФЕРЕНЦИИ по молекулярной и клеточной биологии Института цитологии РАН
- Том: 15
- Тезисы
- Год издания: 2020
- Первая страница: 143
- Последняя страница: 144
- Аннотация: узнавание промотора РНК-полимеразой в процессе транскрипции является фундаментальной проблемой мо-лекулярной генетики. Несмотря на длительный интерес исследователей, эта область продолжает развиваться. большие успехи могут обеспечить методы NGS и мутаци-онный анализ. Недавно подобная работа [1] проведена с целью изучения активности промотора бактериофага т7. Авторы получили 7847 вариантов консенсусного промотора. такие варианты имели от 1 до 10 замен; для для них была оценена активность (как соотноше-ние уровней транскрипта РНК и ДНК). полученные дан-ные подтвердили многие представления о значении от-дельных положений промоторной последовательности и ее областей. В данной работы мы провели дальнейший анализ данных [1], выявив согласованность в измене-ниях отдельных пар оснований промоторных последо-вательностей и функциональных областей промотора T7. В частности, выявлена высокая согласованность мутаций (их совместное присутствие в отдельном про-моторном варианте) для петли специфичности (specificity loop of binding region). Область инициации транскрипции (в которой происходит открытие дуплекса) характеризу-ется наименьшим количеством замен, которые при этом редко сочетаются между собой.В ходе работы отмечена группа промоторных вариан-тов, имеющих точную консенсусную последовательность и случайный нуклеотид в положении -2. Все 4 таких ва-рианта получены в [1] и высокоактивны. при расчете для таких последовательностей профилей электростатиче-ского потенциала и склонностью к изгибам установлены очень существенные изменения при замене в названной позиции. В случае электростатического потенциала за-мены т на А достаточно, чтобы характерный для промо-торов класса II паттерн профилей перешёл в таковой для класса III [2]
- Добавил в систему: Орлов Михаил Анатольевич