Multifaceted Mechanism of Amicoumacin A Inhibition of Bacterial TranslationстатьяИсследовательская статья
Статья опубликована в высокорейтинговом журнале
Информация о цитировании статьи получена из
Web of Science,
Scopus
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 9 апреля 2021 г.
Аннотация:Амикумацин A (Ami) останавливает рост бактерий, ингибируя рибосомы во время трансляции. Сайт связывания Ami находится рядом с кодоном E-сайта мРНК. Однако Ami не мешает взаимодействию рибосомы с мРНК, а скорее стабилизирует его, что относительно необычно и подразумевает уникальный способ ингибирования трансляции. В данной работе мы провели кинетическое и термодинамическое исследование влияния Ami на основные стадии синтеза полипептидов. Мы показываем, что Ami снижает скорость образования функционального канонического инициаторного комплекса (IC) 70S в 30 раз. Кроме того, наши результаты показывают, что Ami способствует формированию ошибочных 30S IC; однако IF3 не дает им продвинуться в направлении инициации трансляции. Во время ранних стадий элонгации Ami не нарушает EF-Tu-зависимое связывание с A-сайтом и образование пептидной связи. С другой стороны, Ami снижает скорость движения пептидил-тРНК от сайта A к сайту P и значительно снижает количество рибосом, способных к синтезу полипептидов. Наши данные показывают, что Ami прогрессивно снижает активность трансляции рибосом, что может оказаться основным ингибирующим механизмом Ami. Действительно, использование мутантов EF-G, которые придают устойчивость к Ami (G542V, G581A или ins544V), приводит к полному восстановлению функциональности рибосом. Возможно, что изменения транслокации, вызванные мутантами EF-G, компенсируют потерю активности, вызванную Ami.