Рибосомная РНК мечниковеллид в транскриптомах грегарин и рДНК микроспоридий sensu lato в метагеномах

Михайлов, К.В.; Насонова, Е.С.; Шишкин, Е.А.; Паскерова, Г.Г.; Симдянов, Т.Г.; Юдина, В.А.; Смирнов, А.В.; Янушковец, Я.; Алешин, В.В.

Авторы: Михайлов К.В., Насонова Е.С., Шишкин Е.А., Паскерова Г.Г., Симдянов Т.Г., Юдина В.А., Смирнов А.В., Янушковец Я., Алешин В.В.
Журнал: ЖУРНАЛ ОБЩЕЙ БИОЛОГИИ
Том: 82
Номер: 3
Год издания: 2021
Издательство: ФГБУ "Издательство "Наука"
Местоположение издательства: Москва
Первая страница: 201
Последняя страница: 228
DOI: 10.31857/s0044459621030040
Аннотация: В метагеномах, транскриптомах и библиотеках ампликонов, используемых для меташтрихкодирования, присутствуют многочисленные нуклеотидные последовательности микроспоридий sensu lato, главным образом относящихся к “Cryptomycota” (Rozellida, Rozellomycota, Rozellosporidia, рассматриваемых здесь как синонимы). В настоящем сообщении мы описываем найденные в транскриптомах одноклеточных из группы Apicomplexa (Alveolata) последовательности рДНК, принадлежащие гиперпаразитическим микроспоридиям-мечниковеллидам. Обнаружено, что транскриптом эугрегарины Polyrhabdina sp. (GenBank SRX6640468) загрязнен кДНК Metchnikovella incurvata, транскриптом архигрегарины Selenidium pygospionis (GenBank SRX6640459) загрязнен кДНК Metchnikovella dogieli, а в транскриптомe бластогрегарины Siedleckia cf. nematoides (GenBank SRX6640464) найдены кДНК, присходящие от вида из неописанного семейства мечниковеллид. С учетом ковариационных нуклеотидных замен смоделирована вторичная структура области “ITS2” идентифицированных и неидентифицированных мечниковеллид. На основе предсказанной вторичной структуры рРНК, картирования чтений из библиотек кДНК, отсутствия эндорибонуклеазы Las1 (PF04031) сделан вывод об отсутствии процессинга ITS2 и наличии ковалентной связи зрелых “5,8S”- и “28S”-подобной (LSU) рРНК мечниковеллид так же, как это известно в отношении других представителей группы типичных микроспоридий. Рассмотрено несколько предложенных ранее (Chytridiopsis typographi, BAQA065) и новых кандидатов на роль сестринской группы микроспоридий sensu stricto. Обсуждается вероятный вклад нейтральных и селективных процессов в эволюцию сверхмалых генов рРНК микроспоридий и сверхдлинных генов рРНК с интронами группы I паразитических и лишайниковых грибов.
Добавил в систему: Симдянов Тимур Геннадьевич

	ИСТИНА	Войти в систему Регистрация
	ИСТИНА ИНХС РАН
	Главная Поиск Статистика О проекте Помощь

ИСТИНА

ИСТИНА ИНХС РАН

Рибосомная РНК мечниковеллид в транскриптомах грегарин и рДНК микроспоридий sensu lato в метагеномахстатья Исследовательская статья

Прикрепленные файлы