|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ИНХС РАН |
||
Геномный каскад промоторов бактериофага T7: участие вызванной суперспиральносттюдестабилизации дуплекса днк (SIDD)тезисы доклада Тезисы
- Автор: Орлов М.А.
- Сборник: «Геномное секвенирование и редактирование» СБОРНИК ТЕЗИСОВ 9-й Всероссийской научно-практической конференции центров геномных исследований мирового уровня. Москва: РНИМУ им. Н.И. Пирогова, 2021. — 24 с
- Серия: «Геномное секвенирование и редактирование»
- Том: 9
- Тезисы
- Год издания: 2021
- Издательство: РНИМУ им. Н. И. Пирогова
- Местоположение издательства: Москва
- Первая страница: 20
- Последняя страница: 20
- Аннотация: В данной работе рассмотрено значение вызванной суперспиральностью дестабилизации дуплекса ДНК (Stress-induced Duplex Destabilization, SIDD) промоторов бактерифага Т7 в регуляции экспрессии его геномного каскада. Ранее для этого физического параметра ДНК показано участие в функционировании ряда областей геномной регуляции, включая промоторы Т7. Действительно, исключительно короткие (~20 нуклеотидов) последовательности нативных промоторов Т7 не могут обьяснить высокоспецифичное настраиваемое (изменяется со сменой фаз жизненного цикла) связывание этих промоторов Т7-РНК-полимеразой. Они слишком близки по последовательности — в ряде случаев и вовсе совпадающей. Естественно предполагать дополнительное участие другого типа кодирования такого молекулярного узнавания —физическими свойствами ДНК. Такие свойства напрямую определяют взаимодействия биомолекул и косвенно кодируются первичной структурой ДНК (что затрудняет их однозначное отнесение к фенотипу либo генотипу). Здесь мы применили расчет с последовательным изменением параметров (температура, ионная сила и суперспиральной плотности) профиля SIDD для всего генома бактериофага T7. Показано, что промоторные области более ранних областей геномного каскада более легкоплавки, что может служить для регуляции экспрессии генов и дифференциального узнавания разных промоторов.
- Добавил в систему: Орлов Михаил Анатольевич