|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ИНХС РАН |
||
Хроматомасс-спектрометрическое профилирование пивоваренных сортов Humulus lupulus для решения задач географической и генетической классификациитезисы доклада Тезисы
- Авторы: Ихалайнен Ю.А., Плющенко И.В., Родин И.А.
- Сборник: Материалы VI Всероссийского симпозиума «Разделение и концентрирование в аналитической химии и радиохимии» с международным участием
- Тезисы
- Год издания: 2021
- Место издания: ООО «ТД Алоста» Краснодар
- Первая страница: 153
- Последняя страница: 153
- Аннотация: Омиксный подход, применимо к анализу объектов царства растений, находит самое разное применение: от решения задач ботанической классификации, до поиска потенциальных биологически активных соединений. Наша работа направленна на классификацию пивоваренных сортов Humulus lupulus на основании данных хроматомасс-спектрометрического профилирования образцов этого растения методом ВЭЖХ-МС высокого разрешения, в том числе, с целью выявления соединений маркеров, характеризующих ту или иную группу. В исследовании участвовало 18 сортов хмеля, каждая в трёх биологических повторностях. В силу специфики ненаправленного эксперимента, была проведена рандомизация экспериментального сиквенса, а так же использовались образцы контроля качества. Хроматографический анализ проводился с использованием хроматомасс-спектрометра Shimadzu LCMS-IT-TOF, оснащенного источником электрораспылительной ионизации и колонки для обращено-фазовой хроматографии Thermo Acclaim RSLC 120 С18. Разметка пиков и выравнивание полученных хроматограмм проводилось с использованием пакетов IРО и ХСМS для языка R. Полученные таблицы пиков прошли процедуру предобработки, включающую такие этапы как: заполнение пропущенных значений, коррекция сигнала, фильтрация и нормализация. Для выявления соединений-маркеров был проведён ряд статистических тестов, предикторы выбирались исходя из пересечения следующих критериев: р значение < 0.05 (t-тест и его непараметрические аналоги), кратность изменения (fold change) > 1, VIP значение из модели ЧНК > 1. Для выбранных соединений были получены спектры фрагментации на разных энергиях, на основании которых была проведена предварительная идентификация компонентов с использованием инструментов для in-silico генерации MS2 спектров (Metfrag и CFM-ID).
- Добавил в систему: Плющенко Иван Викторович
Прикрепленные файлы
| № | Имя | Описание | Имя файла | Размер | Добавлен |
|---|---|---|---|---|---|
| 1. | Полный текст | Ihalajnen.pdf | 377,9 КБ | 13 октября 2021 [Plyush1993] |