|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ИНХС РАН |
||
Гликополимеры клеточных стенок трех новых представителей рода Clavibacterтезисы доклада
- Авторы: Ким Дебора, Тульская Елена Михайловна
- Сборник: Материалы Международного молодежного научного форума «Ломоносов-2021»
- Редакторы: Алешковский Иван Андреевич, Андрианов А.В., Антипов Евгений Александрович, Зимакова Екатерина Игоревна
- Серия: География
- Тезисы
- Год издания: 2021
- Издательство: ООО "МАКС Пресс"
- Местоположение издательства: Москва
- Аннотация: Виды рода Clavibacter (семейство Microbacteriaceae, класс Actinobacteria) являются высокоспециализированными возбудителями болезней экономически важных сельскохозяйственных растений. Ключевую роль в прикреплении фитопатогена к растению-хозяину играют гликополимеры (ГП) клеточных стенок (КС), ковалентно связанные с пептидогликаном, микроорганизма. Изучение ГП КС важно для выяснения механизмов адгезии микроорганизма к растению. Также по данным ряда исследователей состав и структура ГП КС могут послужить хемотаксономическими маркерами вида и подвида, что способствует созданию более точной системы идентификации как патогенных, так и непатогенных представителей рода на фенотипическом уровне. Цель исследования – изучение моносахаридного состава, а также набора и структуры ГП КС трех новых штаммов, выделенных из диких растений пустыни Кызылкум без видимых признаков болезни, Clavibacter sp. ВKM Ас-1371, Clavibacter sp. ВКМ Ac-1372, Clavibacter sp. ВКМ Ac-1374. Эти штаммы были отнесены к роду Clavibacter по ряду фенотипических признаков, а также по сходству нуклеотидных последовательностей генов 16S рРНК новых и типовых штаммов рода Clavibacter (98.5-98.9%).В составе КС трех штаммов основными моносахаридами оказались Gal, Man и Rib. У штамма ВКМ Ac-1372 дополнительно найдена Xyl. Изучение моносахаридного состава в гидролизатах КС позволяет локализовать найденные моносахариды, а также выявить таксон-специфичные моносахариды. Химическими и ЯМР-спектроскопическими методами были определены состав и структура ГП КС изучаемых штаммов. В составе КС трех штаммов не выявлены фосфат-содержащие ГП, но обнаружен идентичный по структуре нейтральный ГП со следующей повторяющейся единицей: →6)-β-D-Galf-(1→6)-β-[α-D-Manp-(1→2)-α-D-Ribf-(1→2)]-D-Galf-(1→. В ГП КС трех штаммов присутствует также кислый полисахарид с повторяющей единицей: →3)-α-D-Galp-(1→3)-α-D-Manp-4,6 Pyr-(1→3)-α-D-Manp-(1→. У штаммов ВКМ Ac-1372 и ВКМ Ac-1374 обнаружен частично О-ацетилированный кислый полисахарид. Настоящее исследование позволило выявить дополнительные хемотаксономические признаки принадлежности исследуемых штаммов к роду Clavibacter и признаки, определяющие принадлежность к разным видам этого рода. Во-первых, наличие пирувилированного галактоманнана, который присутствует во всех изученных штаммах, в том числе, типовом штамме рода C. michiganensis ВKM Ас-1403Т [1]. Заметим, что некоторые повторяющиеся звенья кислого полимера новых штаммов частично ацетилированы. Вопрос, является ли этот структурный элемент достаточным для выделения штамма в отдельный вид, остается открытым. Во-вторых, присутствие (1→6)-β-связанного D-галактофуранана с олигосахаридным боковым заместителем в каждом втором остатке в нейтральных полисахаридах также можно рассматривать как признак принадлежности к роду Clavibacter. Однако, если в случае Ас-1403Т боковой заместитель – трисахарид, соединённый с кором (1→3) связью, то у новых штаммов это дисахарид, объединённый с кором (1→2) связью. Таким образом, природу и локализацию олигосахарида в основной цепи следует рассматривать как хемотаксономический признак принадлежности к отдельному виду рода.
- Добавил в систему: Ким Дебора