Метилирование генов микроРНК miR-129-2, miR-9-1, изменение их экспрессии и активация генов потенциальных мишеней этих микроРНК при раке почкистатья
Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Информация о цитировании статьи получена из
Scopus
Статья опубликована в журнале из перечня ВАК
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 15 июля 2021 г.
Аннотация:Метилирование промоторных CpG-островков и взаимодействие микроРНК с мРНК генов-мишеней входят в число эпигенетических механизмов, которые вносят существенный вклад в нарушение экспрессии генов и сигнальных путей в опухолях. С применением ОТ-ПЦР и ПЦР в реальном времени изучено изменение экспрессии шести опухоль-ассоциированных генов хромосомы 3p (RARB(2), SEMA3B, RHOA, GPX1, NKIRAS1, CHL1) и генов двух микроРНК (MIR-129-2, MIR-9-1) при светлоклеточном почечноклеточном раке (31–48 образцов). Выявлено статистически значимое (р < 0.05 по Фишеру) снижение уровня экспрессии генов SEMA3B, NKIRAS1 и CHL1, изменение экспрессии трех других генов 3p и двух генов микроРНК. С применением метода метилспецифичной ПЦР показано значимое (р < 0.05 по Фишеру) увеличение частоты метилирования генов RARB(2), SEMA3B, MIR-129-2 и MIR-9-1 в опухоли. Обнаружена значимая корреляция между изменением характера метилирования и уровнем экспрессии гена SEMA3B, а также – впервые – RARB(2), GPX1 и MIR-129-2 при светлоклеточном почечноклеточном раке (коэффициент корреляции Спирмена rs = 0.31–0.60, р < 0.05). Показана значимая корреляция между частотой метилирования MIR-129-2 и RARB(2) и прогрессией опухоли. Выявлена значимая положительная корреляция между метилированием MIR-129-2 и повышением уровня мРНК RARB(2), RHOA, NKIRAS1 и CHL1 (rs = 0.35–0.53, р < 0.05). Эти данные указывают на важную роль метилирования в регуляции RARB(2), SEMA3B, GPX1 и MIR-129-2, а также позволяют предположить, что miR-129-2 и метилирование гена этой микроРНК влияют на уровень экспрессии RARB(2), RHOA, NKIRAS1 и CHL1.