КОНЦЕПЦИЯ СОВРЕМЕННЫХ МОЛЕКУЛЯРНЫХ ЧАСОВ И ОПЫТ ОЦЕНКИ ВРЕМЕН ДИВЕРГЕНЦИИ НАСЕКОМОЯДНЫХ И ГРЫЗУНОВ

Банникова, А.А.; Лебедев, В.С.

Авторы: Банникова А.А., Лебедев В.С.
Журнал: ЖУРНАЛ ОБЩЕЙ БИОЛОГИИ
Том: 83
Номер: 1
Год издания: 2022
Издательство: ФГБУ "Издательство "Наука"
Местоположение издательства: Москва
Первая страница: 3
Последняя страница: 28
DOI: 10.31857/S0044459622010031
Аннотация: Почти 60 лет прошло с тех пор, как было обнаружено, что степень различия ДНК двух видов является функцией времени с момента их дивергенции. В дальнейшем стало ясно, что универсальных молекулярных часов не существует, скорость молекулярной эволю-ции широко варьирует в зависимости от гена и филогенетической линии, коррелируя с биологическими характеристиками (продолжительность поколения, размер тела, плодо-витость) и особенностями генома. Развитие концепции молекулярных часов связано с прогрессом методов, позволяющих учитывать и измерять степень непостоянства скорости молекулярной эволюции. В настоящее время большинство датировок выполняется с по-мощью методов нестрогих часов (Relaxed clock), которые опираются на разнообразные модели скорости молекулярной эволюции (например, с автокорреляцией скоростей в со-седних ветвях или без нее). Другой актуальный фактор, позволяющий уменьшить ошибки молекулярных датировок – увеличение объема данных вплоть до геномного уровня, что повышает требования к вычислительной эффективности алгоритмов и методам разложе-ния данных на партиции. Отдельная проблема – нелинейная зависимость оценок скоро-сти эволюции от времени (феномен rate decay), что особенно существенно для анализа недавней истории. В отсутствие адекватной модели эволюции последовательностей нук-леотидов оценки времен могут оказаться существенно смещенными, от чего часто стра-дают результаты, полученные по мтДНК. Одно из важнейших направлений – развитие методов получения калибровочной информации, прежде всего – более полное использо-вание постоянно и быстро растущего объема палеонтологических данных, анализ па-леоДНК и других вариантов гетерохронных данных. Несмотря на то, что точность оценок уровней молекулярных дивергенций продолжает расти, неопределенность датировок со-храняется во многом из-за неоднозначности калибровок и недостатков существующих моделей эволюции.
Добавил в систему: Банникова Анна Андреевна

	ИСТИНА	Войти в систему Регистрация
	ИСТИНА ИНХС РАН
	Главная Поиск Статистика О проекте Помощь

ИСТИНА

ИСТИНА ИНХС РАН

КОНЦЕПЦИЯ СОВРЕМЕННЫХ МОЛЕКУЛЯРНЫХ ЧАСОВ И ОПЫТ ОЦЕНКИ ВРЕМЕН ДИВЕРГЕНЦИИ НАСЕКОМОЯДНЫХ И ГРЫЗУНОВстатья

Прикрепленные файлы