|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ИНХС РАН |
||
Биоинформатический анализ субъединицы эпсилон бактериальной АТФ-синтазы F-типатезисы доклада
- Авторы: Литвин А.В., Фенюк Б.А.
- Сборник: III Объединенный научный форум физиологов, биохимиков и молекулярных биологов. VII съезд биохимиков России. X Российский симпозиум "Белки и пептиды". VII съезд физиологов СНГ. Сочи, Дагомыс, 3–8 октября 2021. Научные труды
- Том: 2
- Тезисы
- Год издания: 2021
- Издательство: Общество с ограниченной ответственностью Издательство Перо
- Местоположение издательства: Москва
- Первая страница: 129
- Последняя страница: 129
- Аннотация: Роторная АТФ-синтаза F-типа (F-АТФаза) — один из ключевых ферментов метаболизма. АТФ-синтазы представляютсобой мультисубъединичные комплексы и сопрягают трансмембранный перенос ионов водорода (или натрия) и реакциюсинтеза/гидролиза АТФ. Для биоинформатического изучения разнообразия генов АТФ-синтазы и поиска корреляций между первичной структурой фермента и его функциональными особенностями в нашей лаборатории был выбран набор геномовпрокариот из базы данных кластеров ортологичных генов (COG, https://www.ncbi.nlm.nih.gov/research/cog). База данных COG построена на геномах 711 организмов, относительно равномерно покрывающих все филогенетическое разнообразие прокариот (83 архей и 628 бактерий). Субъединица ε бактериальой F-АТФ-синтазы представляет собой небольшой белок из двух доменов – N-концевой бета-бочки, играющей структурную роль, и подвижного α-спирального C-концевого домена, способного изменять конформацию в зависимости от условий. N-концевой домен необходим для сопряжения протонного транспорта, а С-концевой домен способен селективно ингибировать АТФазную активность фермента. У некоторых бактерий субъединица ε сама способна связывать АТФ; при этом стабилизируется конформация, не оказывающая ингибиторного действия на АТФазную активность. В данной работе был проведен биоинформатический анализ многообразия вариантов субъединицы ε бактериальных F-АТФ-синтаз и поиск корреляций между первичной структурой ее регуляторного домена и физиологическими особенностями бактерий.
- Добавил в систему: Лапашина Анна Сергеевна