|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ИНХС РАН |
||
Система репарации "мисматчей" распознает N2-гетероарильные аддукты гуанозина в ДНКтезисы доклада
- Авторы: Павлова А.В., Маруяма А., Масаки И., Монахова М.В., Сейо К., Кубарева Е.А.
- Сборник: Сборник тезисов 25-ой Пущинской школы-конференции молодых ученых с международным участием «БИОЛОГИЯ – НАУКА XXI ВЕКА»
- Тезисы
- Год издания: 2022
- Место издания: ФИЦ ПНЦБИ РАН г. Пущино Московской области
- Первая страница: 139
- Последняя страница: 140
- Аннотация: Репарация «мисматчей» в ДНК (MMR) играет важную роль в поддержании стабильности генома. Белок MutS отвечает за распознавание «мисматчей» – ошибок,возникающих в ходе репликации ДНК, а также за последующее привлечение белков MutL и MutH в E. coli. Чувствительная к профилю метилирования ДНК никующая эндонуклеаза MutH вносит одноцепочечный разрыв в «дочернюю» цепь, а MutL осуществляет координацию данного процесса, взаимодействуя с MutS и активируя MutH. Белки MMR могут участвовать в распознавании ряда других повреждений ДНК, включая некоторые объёмные аддукты нуклеотидов, которые, как правило, являются субстратами системы эксцизионной репарации нуклеотидов (NER). В данной работе мы демонстрируем новые данные, которыесвидетельствуют о перекрывании функций между системами MMR и NER. Нами исследовано связывание ДНК с модифицированным N2-гетероарил-дезоксигуанозином (HA-dG) белками MMR E. coli. Использованные модельные аддукты гуанина с шестью типами шестичленных гетероароматических колец, содержащих один или два атома азота (производные пиридина, пиридазина, пиримидина или пиразина), напоминают аддукты с гетероциклическими аминами – канцерогенами, которые встречаются в табачномдыме и жареном мясе. Методом «торможения в геле» показано, что эффективность комплексообразования MutS с 17-звенными дуплексами, содержащими N2-гетероарил-производные dG (HA-ДНК) как в составе пары с dC, так и в составе пары с T, в 2–4 раза выше, чем c немодифицированной ДНК с G/T-«мисматчем». Корреляция между стабильностьюHA-ДНК дуплексов и их сродством к MutS не обнаружена. Моделирование комплекса междуHA-ДНК и MutS методом молекулярной динамики показало, что высокое сродство к ДНК, содержащей как HA-dG/T, так и HA-dG/C, может быть обусловлено взаимодействием ДНК-связывающего центра белка с гетероароматической модификацией dG. Таким образом, возможно, мы открыли новый механизм связывания MutS с HA-ДНК, отличный отвзаимодействия этого белка с «мисматчем». Проанализирована активация начального этапаMMR, представляющего собой расщепление HA-ДНК комплексом ферментов MutS, MutL и MutH E. coli. Все модельные ДНК с HA-dG инициировали репарацию независимо от наличия в них пары G/T. Однако эффективность этого процесса была различной (продемонстрировано как увеличение, так и уменьшение доли ДНК с внесенным разрывом по сравнению с G/T-«мисматчем») и не зависела от сродства HA-ДНК к MutS или к MutL. Вероятно, существует пока не выявленный структурный фактор в HA-dG, влияющий на инициацию MMR.Исследование выполнено при поддержке Российского научного фонда (проект № 21-14-00161).
- Добавил в систему: Кубарева Елена Александровна
Прикрепленные файлы
| № | Имя | Описание | Имя файла | Размер | Добавлен |
|---|---|---|---|---|---|
| 1. | Полный текст | Biologiya_21_veka_Pavlova.pdf | 579,7 КБ | 20 декабря 2022 [KubarevaEA] | |
| 2. | Полный текст | Biologiya_21_veka_Pavlova.pdf | 579,7 КБ | 20 декабря 2022 [KubarevaEA] |