|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ИНХС РАН |
||
Анализ последовательностей белка TolC из Escherichia coli, ключевогокомпонента TolC-содержащих помп грамотрицательных бактерийтезисы доклада Тезисы
- Авторы: Ралдугина В.Н., Назаров П.А.
- Сборник: VIII Пущинской школы-конференции «Биохимия, физиология и биосферная роль микроорганизмов»
- Тезисы
- Год издания: 2022
- Аннотация: Транспортеры (помпы) множественной лекарственной устойчивости (МЛУ)являются краеугольным камнем защиты бактерий от антибиотиков. Помпы МЛУсоставляют основу неспецифической защиты бактерий, в то время как модификациямишени лекарственного средства, инактивация лекарственного средства, переключениемишени или секвестрация мишени - специфическая линия их защиты. Сформированнаяпомпами МЛУ неспецифическая защита формирует барьер, препятствующий попаданиюантибактериальных веществ внутрь клетки, что является основным фактором,определяющим устойчивость бактерий [1].В настоящее время известно шесть семейств помп МЛУ: MFS (major facilitatorsuperfamily), MATE (multidrug and toxin extrusion), SMR (small multidrug resistance), RND(resistance-nodulation-cell division), PACE (proteobacterial antimicrobial compound efflux) исемейство АВС-транспортеров (ATP-binding cassette). АВС-транспортеры напрямуюиспользуют энергию АТФ для осуществления транспорта, тогда как остальные пятьсемейств являются вторичными активными транспортерами, использующимиэлектрохимическую энергию трансмембранного потенциала [2].TolC-содержащие транспортеры грамотрицательных бактерий являютсяобособленной группой из 8 транспортеров семейств RND, ABC и MSF, которыеобъединены одной особенностью - в составе каждого из них содержится порин наружноймембраны TolC. Одной из наиболее изученных помп МЛУ является помпа AcrAB-TolC(или AcrABZ-TolC) бактерии E. coli. Помпа AcrAB-TolC имеет довольно большуюсубстратную специфичность, откачивает субстраты из внутренней мембраны бактерии ипериплазматического пространства и является основной помпой МЛУ для E. coli иблизкородственных видов [3].Исследование последовательностей помп представляет важную задачу пониманияпроцессов образования новых клинических изолятов-супербактерий, так какрезистентность за счёт оттока занимает важное место в общем числе резистентныхбактерий, возникающих в следствии антибиотикотерапии. Считается, что гены,кодирующие помпы МЛУ, вариабельны и относятся к так называемым генам «роскоши»,т. е. предназначены для адаптации бактерий к изменению окружающих условий. Однакоанализ последовательностей AcrA, AcrB и TolC у основных лабораторных штаммов [4]показал, что что штаммы из разных стран, культивируемые в лабораториях уже долгоевремя, имеют удивительную консервативность последовательностей белков помпыAcrAB-TolC.В настоящей работе мы продолжили исследования последовательности белка TolCсреди всех известных штаммов E. coli, выявили несколько консенсусныхпоследовательностей, нашли все мутации и определили их частоты, рассчитали частотызамен аминокислот и получили исчерпывающую информацию о мутациях, влияющих наструктуру белка TolC.
- Добавил в систему: Назаров Павел Александрович