Оценка потенциальных референсных генов для нормализации данных ПЦР-РВ в экспериментах с клетками линии HeLaстатья
Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Статья опубликована в журнале из перечня ВАК
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 23 сентября 2021 г.
Аннотация:Основным критерием выбора гена в качестве референсного для нормализации данных ПЦР в режиме реального времени является постоянство уровня его экспрессии во всех рассматриваемых
в ходе исследования условиях. В данной работе основные методы изучения стабильности экспрессии потенциальных референсных генов (Delta-Ct, geNorm, qBase и эквивалент-тест Халлера) были применены в отношении одной из наиболее широко используемых в современных исследованиях клеточных моделей — линии HeLa. Оценивалась стабильность экспрессии семи генов-кандидатов — HPRT1, ACTB, GAPDH, RPS18, HSPC3, UBC и SDHA — в стандартных условиях, в условиях теплового шока и в процессе релаксации. По совокупным результатам всех использованных методов гены RPS18 и HSPC3, обладающие наибольшей стабильностью экспрессии в рамках использованной модели, были выбраны в качестве референсных.