Simplex Droplet Digital PCR Assays for the Detection of TERT Promoter Mutations in Urine Samples for the Non-invasive Diagnosis of Urothelial Cancerстатья
Информация о цитировании статьи получена из
Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 15 февраля 2024 г.
Аннотация:Соматические мутации в области промотора теломеразы обратной транскриптазы (TERT) очень часто встречаются при уротелиальном раке (ЯК), и их обнаружение в моче (бесклеточная ДНК из супернатанта мочи или ДНК из отслоившихся клеток в осадке мочи) продемонстрировало многообещающие доказательства. в качестве предполагаемых неинвазивных биомаркеров для обнаружения и мониторинга ЯК. Однако обнаружение этих опухолевых мутаций в моче требует высокочувствительных методов, позволяющих измерять мутации низкоаллельной фракции. Мы разработали чувствительный капельный цифровой ПЦР (ddPCR) для обнаружения мутаций промотора TERT в моче (uTERTpm), нацеленный на две наиболее распространенные мутации (C228T и C250T), а также редкие мутации A161C, C228A и CC242-243TT. Здесь мы описали пошаговый протокол скрининга мутаций uTERTpm с использованием симплексного анализа ddPCR и дали некоторые рекомендации по выделению ДНК из образцов мочи. Мы также приводим пределы обнаружения для двух наиболее частых мутаций и обсуждаем преимущества метода клинической реализации тестов для обнаружения и мониторинга ЯК.