ВЗАИМОСВЯЗЬ ДНРНК-GHETL И МИКРОРНК ПРИ РАКЕ ПРЕДСТАТЕЛЬНОЙ ЖЕЛЕЗЫ

ТИМОФЕЕВА, С.В.; ФИЛИППОВА, С.Ю.; СИТКОВСКАЯ, А.О.; НОВИКОВА, И.А.

Авторы: ТИМОФЕЕВА С.В., ФИЛИППОВА С.Ю., СИТКОВСКАЯ А.О., НОВИКОВА И.А.
Сборник: ВОПРОСЫ ОНКОЛОГИИ
Серия: Материалы IX Петербургского международного онкологического форума «Белые ночи • 2023»
Том: 69
Тезисы
Год издания: 2023
Издательство: Национальный медицинский исследовательский центр им. В.А. Алмазова
Местоположение издательства: Санкт-Петербург
Первая страница: 136
Последняя страница: 137
Аннотация: АктуальностьМногочисленные исследования показали, что длинные некодирующие РНК (днРНК) играют важную рольв возникновении и развитии различных видов рака [1]. Так, например, днРНК GHET1 способствует ростурака предстательной железы через сигнальные пути окислительного стресса и противостоит противоопухолевому лекарственному средству паклитакселу, которое в будущем можно использовать в качестве мишенидля противоопухолевой терапии и терапии лекарственной устойчивости в клиниках [2].ЦельЦелью нашего исследования был биоинформатический поиск взаимодействия днРНК- GHET1 и микроРНКпри раке предстательной железы.Материалы и методыКомплексный поиск взаимодействия днРНК- GHET1 (ENST00000627071) и микроРНК при раке предстательной железы был проведен с помощью алгоритма LncRRIsearch [3]. LncRRIsearch включает в себя множествоанализов локальных взаимодействий оснований, предсказанных Riblast для каждой днРНК. Основными критериями, используемыми для определения наиболее вероятных взаимодействий между мРНК и днРНК, являетсяминимальная свободная энергия (KCAL/MOL). Далее мы проанализировали три установленных взаимодействияднРНК с транскриптом GHET1 (ENST00000627071), используя базу данных LNCRNASNP2-HUMAN [4], иопределили связанные с ними микроРНК при RPM>=1 (т.е. микроРНК с высокой экспрессий).РезультатыДля транскрипта GHET1 (ENST00000627071) мы идентифицировали более трех днРНК, которые продемонстрировали наибольшую вероятность взаимодействия: RP11-573D15.8-018 (ENST00000627551), LA16c358B7.4-001 (ENST00000339021) и RP13-580B18.4-001 (ENST00000624628). Далее мы провели поиск микроРНКс высокой экспрессией в регионах выше упомянутых днРНК и установили, что при условии RPM>=1,RP11-573D15.8-018 взаимодействует с miR-1266-5p и miR-766-3p. В то же время LA16c-358B7.4-001 взаимодействует с 22 микроРНК: miR-150-5p, miR-210-3p, miR-326, miR-550a-5p, miR-517-5p, miR-197-3p, miR26b-3p, miR-550a-3p, miR-2355-5p, miR-223-3p, miR-433-3p, miR-3614-5p, miR-654-5p, miR-30b-3p, miR-940,miR-128-3p, miR-214-3p, miR-760, miR-370-3p, miR-942-5p, miR-193b-5p, miR-513a-5p. RP13-580B18.4-001связана с miR-500a-3p, miR-892b, miR-1258, miR-512-5p, miR-134-5p, miR-31-5p, miR-498, miR-17-3p, miR124-3p, miR-125b-2-3p, miR-1180-3p, miR-127-5p, miR-328-3p, miR-486-5p, miR-708-5p, miR-3127-5p, miR-940,miR-28-5p, miR-202-3p, miR-1254, miR-30b-3p, miR-509-5p, miR-509-3-5p, miR-378c, miR-146b-3p.ВыводыВ результате мы получили функциональные карты, которые могут быть полезны для дальнейших исследований новых возможных маркеров для ранней диагностики рака предстательной железы.
Добавил в систему: Тимофеева Софья Владимировна

	ИСТИНА	Войти в систему Регистрация
	ИСТИНА ИНХС РАН
	Главная Поиск Статистика О проекте Помощь

ИСТИНА

ИСТИНА ИНХС РАН

ВЗАИМОСВЯЗЬ ДНРНК-GHETL И МИКРОРНК ПРИ РАКЕ ПРЕДСТАТЕЛЬНОЙ ЖЕЛЕЗЫтезисы доклада Тезисы

Прикрепленные файлы