Пространственная организация генов домашнего хозяйства в интерфазных ядрахстатья
Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Информация о цитировании статьи получена из
Scopus
Статья опубликована в журнале из перечня ВАК
Статья опубликована в журнале из списка Web of Science и/или Scopus
Дата последнего поиска статьи во внешних источниках: 25 апреля 2017 г.
Аннотация:Пространственная организация эукариотического генома тесно связана с его функционированием. В частности, взаимодействие промоторов генов с удаленными энхансерными элементами в составе активаторных хроматиновых блоков, а также привлечение генов к общим транскрипционным фабрикам играет важную роль в активации транскрипции генов. Большинство работ, посвященных анализу пространственного взаимодействия регуляторных элементов генома, выполнено на моделях тканеспецифичных генов. Между тем остается не ясным, какой вклад в пространственную организацию хромосом вносят гены домашнего хозяйства, которые транскрибируются в большинстве клеточных типов и числом заметно превосходят число транскрибирующихся тканеспецифичных генов. С целью ответить на этот вопрос мы провели полногеномный анализ пространственных взаимодействий генов домашнего хозяйства курицы CARHSP1 и TRAP1, расположенных на хромосоме 14, используя для этого технологию 4С. Установлено, что для промоторов этих генов повышена частота ассоциации с транскрипционно активными областями хромосом и с участками, обогащенными сайтами связывания общего транскрипционного фактора Sp1 и CpG-островками, которые маркируют промоторы генов домашнего хозяйства. В то же время, при анализе взаимодействий участка хромосомы 14 из обедненной генами области не обнаружено подобных преференций. Указания на ассоциацию промоторов генов домашнего хозяйства получены и в независимых цитологических экспериментах по визуализации неметилированных CpG-осровков в индивидуальных ядрах клеток человека. В них выявлена кластеризация CpG-островков в ядерном пространстве. В результате проведенных исследований получены доказательства того, что взаимодействие промоторов генов домашнего хозяйства – важный фактор, определяющий пространственную организацию интерфазных хромосом.