Место издания:ООО "ИД "Вода: химия и экология" Пущино Пущино
Первая страница:86
Последняя страница:87
Аннотация:Цель исследования – сравнительное изучение моносахаридного состава, набора и структуры гликополимеров клеточных стенок типового штамма Cl. michiganensis subsp. michiganensis ВKM Ас-1403T (фитопатоген) и штамма Clavibacter sp. ВКМ Ac-1371, выделенного из Salsola sp. (солянка) без выраженных признаков заболевания. Согласно результатам филогенетического анализа (16S рРНК, GyrB) и MALDI-TOF спектров целых клеток, штамм ВКМ Ac-1371 относится к новому подвиду Cl. michiganensis.
В составе клеточных стенок обоих штаммов преобладающими моносахаридами оказались галактоза и манноза. У типового штамма дополнительно найдены рамноза, фукоза и глюкозамин, тогда как у изолята из Salsola sp. – рибоза.
Изучение моносахаридного состава в гидролизатах клеточных стенок позволяет локализовать найденные моносахариды, а также выявить таксон-специфичные моносахариды.
Химическими и ЯМР-спектроскопическими методами были определены состав и структура гликополимеров клеточных стенок изучаемых штаммов.
В составе клеточных стенок обоих штаммов не выявлены фосфат-содержащие гликополимеры, но обнаружен идентичный по структуре кислый гликополимер со следующей повторяющейся единицей:
→3)-α-D-Galp-(1→3)-α-D-Manp-4,6 Pyr-(1→3)-α-D-Manp-(1→
Наличие кетально связанного остатка пировиноградной кислоты обусловливает отрицательный заряд гликополимера.
В клеточных стенках штамма ВKM Ас-1403T присутствует также нейтральный полисахарид с повторяющейся единицей:
→6)-β-Galf-(1→6)-β-[-(3→1)-α-D-Fucp-(2→1)-α-L-Rhap-(3→1)-β-D-GlcpNAc]-Galf-(1→.
У штамма ВКМ Ac-1371 обнаружен нейтральный полисахарид другой структуры: →6)-β-D-Galf-(1→6)-β-D-[-(2→1)-α-D-Ribf-(2→1)-α-D-Manp]-Galf-(1→.
Таким образом, представители разных подвидов Cl. michiganensis имеют различные профили моносахаридов и гликополимеров клеточных стенок. Следует также отметить, что вышеуказанные структуры полимеров обнаружены у прокариот впервые.
Работа выполнена при частичной поддержке гранта РФФИ № 16-34-01048 мол_а.