|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ИНХС РАН |
||
Изучение принципов формирования нуклеосом методами молекулярного моделированиядипломная работа (Специалист)
- Научный руководитель: Шайтан А.К.
- Автор: Армеев Г.А.,
- Тип: Специалист
- Организация, в которой проходила защита: МГУ имени М.В. Ломоносова
- Год защиты: 2014
- Аннотация: Работа посвящена изучению принципов устройства и формирования нуклеосом с помощью молекулярного моделирования. Проводится обзор литературных источников по объекту исследования – нуклеосомам. Производится описание теоретических основ компьютерного молекулярного моделирования методом молекулярной динамики, а так же методов расчета электростатических характеристик молекулярных систем. В работе производится полноатомное моделирование нуклеосомы в явном растворителе в силовом поле AMBER 99 BSC0 на временном промежутке 1 мкс. Производится ковариационный анализ траектории молекулярной системы с последующим исследованием обнаруженных коллективных движений. Предлагается метод, позволяющий вычислять распределения физических величин в объеме расчетной ячейки вокруг дрейфующей макромолекулы. Определяется распределение молекул воды в системе, предполагается роль внутринуклеосомальной воды. Определяется распределение одновалентных ионов в системе, выявляются места предпочтительного нахождения ионов, предлагается функция, выполняемая ионами, окружающими нуклеосомы. Рассматривается распределение электростатического потенциала вокруг нуклеосомы.
- Добавил в систему: Шайтан Алексей Константинович