Выберите категорию обращения:
Общие вопросы
Отчеты
Рейтинги
Мониторинговый отчёт
Диссертационные советы
Конкурсы
Ввод данных
Структура организаций
Аспирантура
Научное оборудование
Импорт педагогической нагрузки
Журналы и импакт-факторы
Тема обращения:
Описание проблемы:
Введите почтовый адрес:
ИСТИНА
Войти в систему
Регистрация
ИСТИНА ИНХС РАН
Главная
Поиск
Статистика
О проекте
Помощь
В связи с техническими работами в центре обработки данных, часть прикреплённых файлов в настоящее время недоступна.
скрыть
отправить сообщение
Миронов Владимир Андреевич
пользователь
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Химический факультет
,
Кафедра физической химии
, старший научный сотрудник, с 12 января 2015
кандидат физико-математических наук с 2013 года
Прежние места работы
(Нажмите для отображения)
МГУ имени М.В. Ломоносова
,
Химический факультет
,
Кафедра физической химии
, младший научный сотрудник, 28 сентября 2009 - 11 января 2015
Соавторы:
Немухин А.В.
,
Alexeev Y.
,
Московский А.А.
,
Григоренко Б.Л.
,
Хренова М.Г.
,
Fedorov D.G.
,
Tomilin F.N.
,
Куликов И.М.
,
Савицкий А.П.
,
Chernykh I.
,
Поляков И.В.
,
Щугорева И.А.
,
Gordon M.S.
показать полностью...
,
Kichkailo A.S.
,
Kudryavtsev A.
,
Moryachkov R.V.
,
Semin A.
,
Дружинин Е.А.
,
Berezovski M.V.
,
D’Mello M.
,
Goryashenko A.S.
,
Hui L.
,
Pruitt S.R.
,
Zamay T.N.
,
Андрийченко Н.Н.
,
Брехов А.Т.
,
Вшивков В.А.
,
Лычко Л.А.
,
Морозов Д.И.
,
Шмелев А.Б.
,
Artyushenko P.V.
,
Barca Giuseppe M.J.
,
Bertoni C.
,
Bravaya K.B.
,
Cappello F.
,
Carrington L.
,
Chapagain P.P.
,
Collins J.
,
Condorelli G.
,
Datta D.
,
Delyakov D.
,
Di S.
,
Emiliano D.J.
,
Gaenko A.
,
Gok A.M.
,
Golovnev N.N.
,
Gour J.R.
,
Groenhof G.
,
Guidez E.
,
Gunina A.O.
,
Harville T.
,
Igor C.
,
Irle S.
,
Ivanic J.
,
Keipert K.
,
Kowalski K.
,
Krylov A.
,
Laurent A.D.
,
Leang S.S.
,
Liang X.
,
Lutz J.J.
,
Magoulas I.
,
Mato J.
,
Migal Y.
,
Molokeev M.S.
,
Mulligan V.K.
,
Nakata H.
,
Nikiforov A.A.
,
Peng X.
,
Pham B.Q.
,
Piecuch P.
,
Poole D.
,
Prigarin V.
,
Rendell A.P.
,
Roskop L.B.
,
Ruedenberg K.
,
Sattasathuchana T.
,
Schmidt M.W.
,
Shen J.
,
Silva N.D.
,
Slipchenko L.
,
Song Y.
,
Sosonkina M.
,
Streltsova O.
,
Sundriyal V.
,
Tao D.
,
Tiwari A.
,
Topol I.
,
Tutukov A.V.
,
Umeda H.
,
Vallejo Jorge L.G.
,
Veprintsev D.V.
,
Vladimir P.
,
Wei L.
,
Westheimer B.
,
Włoch M.
,
Zahariev F.
,
Zamay G.S.
,
de Franciscis V.
,
Боченкова А.В.
,
Заблуда В.Н.
,
Кулакова А.М.
,
Русанов А.Л.
,
Саркисов О.М.
,
Соколов А.Е.
,
Шелаев И.В.
,
Шмелев А.В.
31 статья
,
43 доклада на конференциях
,
12 тезисов докладов
,
20 НИР
,
2 награды
,
1 членство в научном обществе
,
1 диссертация
,
2 дипломные работы
,
3 выступление в СМИ
Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 392, Scopus: 476
РИНЦ:
IstinaResearcherID (IRID): 546297
ResearcherID:
I-4712-2012
Scopus Author ID:
56245533900
ORCID:
0000-0002-9454-5823
Деятельность
Статьи в журналах
2022
Structure and Interaction Based Design of Anti-SARS-CoV-2 Aptamers
Mironov Vladimir
,
Shchugoreva Irina A.
,
Artyushenko Polina V.
,
Morozov Dmitry
, Borbone Nicola, Oliviero Giorgia,
Zamay Tatiana N.
,
Moryachkov Roman V.
, Kolovskaya Olga S., Lukyanenko Kirill A.,
Song Yangling
, Merkuleva Iuliia A.,
Zabluda Vladimir N.
, Peters Georgy, Koroleva Lyudmila S., Veprintsev Dmitry V., Glazyrin Yury E., Volosnikova Ekaterina A., Belenkaya Svetlana V., Esina Tatiana I., Isaeva Anastasiya A., Nesmeyanova Valentina S., Shanshin Daniil V., Berlina Anna N., Komova Nadezhda S., Svetlichnyi Valery A., Silnikov Vladimir N., Shcherbakov Dmitriy N., Zamay Galina S., Zamay Sergey S., Smolyarova Tatyana, Tikhonova Elena P., Chen Kelvin H.C., Jeng U-Ser,
Condorelli Gerolama
,
de Franciscis Vittorio
,
Groenhof Gerrit
, Yang Chaoyong,
Moskovsky Alexander A.
,
Fedorov Dmitri G.
,
Tomilin Felix N.
, Tan Weihong,
Alexeev Yuri
,
Berezovski Maxim V.
,
Kichkailo Anna S.
в журнале
Chemistry - A European Journal
, издательство
John Wiley & Sons Ltd.
(United Kingdom)
DOI
2021
Applying joint theoretical experimental research to aptamer modeling
Shchugoreva Irina A.
, Artyushenko Polina V.,
Tomilin Felix N.
, Morozov Dmitry I.,
Mironov Vladimir A.
,
Moryachkov Roman V.
, Kichkailo Anna
в журнале
Сибирское медицинское обозрение
, издательство
Красноярский государственный медицинский университет им. проф. В.Ф. Войно-Ясенецкого
(Красноярск)
, № 2, с. 105-106
DOI
2021
Computational approach to design of aptamers to the receptor binding domain of SARS-CoV-2
Artyushenko Polina V.,
Mironov Vladimir A.
, Morozov Dmitry I.,
Shchugoreva Irina A.
, Borbone Nicola,
Tomilin Felix N.
,
Kichkailo Anna
в журнале
Сибирское медицинское обозрение
, издательство
Красноярский государственный медицинский университет им. проф. В.Ф. Войно-Ясенецкого
(Красноярск)
, № 2, с. 66-67
DOI
2021
Luminescent Zero-Dimensional Hybrid Lead Thiohalide Nanostructures for High Quantum Yield and Broadband Excitation
Golovnev Nicolay N.
, Aleksandrovsky Aleksandr S., Gerasimova Marina A.,
Tomilin Felix N.
,
Mironov Vladimir A.
, Demina Anastasia V., Xia Zhiguo,
Molokeev Maxim S.
в журнале
ACS Applied Nano Materials
, издательство
American Chemical Society
(United States)
, том 4, № 4, с. 3654-3663
DOI
2021
The role of SAXS and molecular simulations in 3D structure elucidation of a DNA aptamer against lung cancer
Morozov Dmitry
,
Mironov Vladimir
,
Moryachkov Roman V.
,
Shchugoreva Irina A.
, Artyushenko Polina V.,
Zamay Galina S.
, Kolovskaya Olga S.,
Zamay Tatiana N.
, Krat Alexey V., Molodenskiy Dmitry S., Zabluda Vladimir N.,
Veprintsev Dmitry V.
,
Sokolov Alexey E.
, Zukov Ruslan A.,
Berezovski Maxim V.
,
Tomilin Felix N.
,
Fedorov Dmitri G.
,
Alexeev Yuri
,
Kichkailo Anna S.
в журнале
Molecular therapy. Nucleic acids
, издательство
Nature Publishing Group
(United Kingdom)
, том 25, с. 316-327
DOI
2020
Recent developments in the general atomic and molecular electronic structure system
Barca Giuseppe M.J.
,
Bertoni Colleen
,
Carrington Laura
,
Datta Dipayan
,
Silva Nuwan De
,
Emiliano Deustua J.
,
Fedorov Dmitri G.
,
Gour Jeffrey R.
,
Gunina Anastasia O.
,
Guidez Emilie
,
Harville Taylor
,
Irle Stephan
,
Ivanic Joe
,
Kowalski Karol
,
Leang Sarom S.
,
Hui Li
,
Wei Li
,
Lutz Jesse J.
,
Magoulas Ilias
,
Mato Joani
,
Mironov Vladimir
,
Nakata Hiroya
,
Pham Buu Q.
,
Piecuch Piotr
,
Poole David
,
Pruitt Spencer R.
,
Rendell Alistair P.
,
Roskop Luke B.
,
Ruedenberg Klaus
,
Sattasathuchana Tosaporn
,
Schmidt Michael W.
,
Shen Jun
,
Slipchenko Lyudmila
,
Sosonkina Masha
,
Sundriyal Vaibhav
,
Tiwari Ananta
,
Vallejo Jorge L.Galvez
,
Westheimer Bryce
,
Włoch Marta
,
Peng Xu
,
Zahariev Federico
,
Gordon Mark S.
в журнале
Journal of Chemical Physics
, издательство
AIP Publishing
(United States)
, том 152, № 15, с. 154102
DOI
2019
3-D electronic density maps for enzyme reaction intermediates: big data and high performance computing services in a virtualized environment
Brekhov Anton
,
Mironov Vladimir
,
Moskovsky Alexander
, Podgainiy Dmitry,
Streltsova Oksana
,
Delyakov Dmitry
в журнале
Journal of Physics: Conference Series
, издательство
IOP Publishing
([Bristol, UK], England)
, том 1392, с. 012049
DOI
2019
A systematic study of minima in alanine dipeptide
Mironov Vladimir
,
Alexeev Yuri
,
Mulligan Vikram Khipple
,
Fedorov Dmitri G.
в журнале
Journal of Computational Chemistry
, издательство
John Wiley & Sons Inc.
(United States)
, том 40, № 2, с. 297-309
DOI
2019
Molecular Electrostatic Potential and Electron Density of Large Systems in Solution Computed With the Fragment Molecular Orbital Method
Fedorov Dmitri G.
,
Brekhov Anton
,
Mironov Vladimir A.
,
Alexeev Yuri
в журнале
The Journal of Physical Chemistry A: Molecules, Clusters, and Aerosols
, издательство
American Chemical Society
(United States)
, том 123, № 29, с. 6281-6290
DOI
2019
Multithreaded parallelization of the energy and analytic gradient in the fragment molecular orbital method
Mironov Vladimir
,
Alexeev Yuri
,
Fedorov Dmitri G.
в журнале
International Journal of Quantum Chemistry
, издательство
John Wiley & Sons Inc.
(United States)
, том 119, № 12, с. e25937
DOI
2018
Benchmarking Quantum Chemistry Methods in Calculations of Electronic Excitations
Grigorenko Bella L.
,
Mironov Vladimir A.
,
Polyakov Igor V.
,
Nemukhin Alexander V.
в журнале
Supercomputing Frontiers and Innovations
, том 5, № 4, с. 62-66
DOI
2018
Modeling structure and excitation of biliverdin-binding domains in infrared fluorescent proteins
Polyakov Igor V.
,
Grigorenko Bella L.
,
Mironov Vladimir A.
,
Nemukhin Alexander V.
в журнале
Chemical Physics Letters
, издательство
Elsevier BV
(Netherlands)
, том 710, с. 59-63
DOI
2017
An efficient MPI/OpenMP parallelization of the Hartree–Fock–Roothaan method for the first generation of Intel Xeon Phi processor architecture
Mironov Vladimir
,
Moskovsky Alexander
,
D’Mello Michael
,
Alexeev Yuri
в журнале
International Journal of High Performance Computing Applications
, издательство
SAGE Publications
(United States)
DOI
2016
Server Level Liquid Cooling: Do Higher System Temperatures Improve Energy Efficiency?
Moskovsky A.
,
Druzhinin E.
,
Shmelev A.
,
Mironov V.
,
Semin A.
в журнале
Supercomputing Frontiers and Innovations
, том 3, № 1, с. 67-74
DOI
2016
Особенности расчетов профилей свободной энергии ферментативных реакций: Гидролиз гуанозинтрифосфата белковым комплексом Ras-GAP
Миронов В.А.
,
Лычко Л.А.
,
Хренова М.Г.
в журнале
Вестник Московского университета. Серия 2: Химия
, издательство
Издательский дом МГУ
(Москва)
, том 57, № 5, с. 1-4
2015
Computational characterization of the chemical step in the GTP hydrolysis by Ras-GAP for the wild-type and G13V mutated Ras
Mironov Vladimir A.
,
Khrenova Maria G.
,
Lychko Leonora A.
,
Nemukhin Alexander V.
в журнале
Proteins: Structure, Function and Bioinformatics
, издательство
Wiley-Liss Inc
(United States)
, том 83, № 6, с. 1046-1053
DOI
2015
Why does mutation of Gln61 in Ras by the nitro analog NGln maintain activity of Ras-GAP in hydrolysis of guanosine triphosphate?
Khrenova Maria G.
,
Grigorenko Bella L.
,
Mironov Vladimir A.
,
Nemukhin Alexander V.
в журнале
Proteins: Structure, Function and Bioinformatics
, издательство
Wiley-Liss Inc
(United States)
, том 83, № 11, с. 2091-2099
DOI
2014
Modeling the role of G12V and G13V Ras mutations in the RasGAP-catalyzed hydrolysis reaction of guanosine triphosphate
Khrenova Maria G.
,
Mironov Vladimir A.
,
Grigorenko Bella L.
,
Nemukhin Alexander V.
в журнале
Biochemistry
, издательство
American Chemical Society
(United States)
, том 53, № 45, с. 7093-7099
DOI
2014
On the Role of Zwitterions in Kindling Fluorescent Protein Photochemistry
Mironov Vladimir A.
,
Bravaya Ksenia B.
,
Nemukhin Alexander V.
в журнале
Journal of Physical Chemistry B
, издательство
American Chemical Society
(United States)
DOI
2014
The photoreaction mechanism in the bacterial blue light receptor BLUF according to metadynamics modeling
Khrenova M.G.,
Nikiforov A.A.
,
Andrijchenko N.N.
,
Mironov V.A.
,
Nemukhin A.V.
в журнале
Moscow University Chemistry Bulletin
, издательство
Allerton Press Inc.
(United States)
, том 69, № 4, с. 149-151
DOI
2014
Механизм фотореакции в бактериальном рецепторе синего света BLUF по результатам моделирования методом метадинамики
Хренова М.Г.
, Никифоров А.А.,
Андрийченко Н.Н.
,
Миронов В.А.
,
Немухин А.В.
в журнале
Вестник Московского университета. Серия 2: Химия
, издательство
Издательский дом МГУ
(Москва)
, том 55, № 4, с. 195-198
2013
Thermal Isomerization of the Chromoprotein asFP595 and Its Kindling Mutant A143G: QM/MM Molecular Dynamics Simulations
Mironov Vladimir A.
,
Khrenova Maria G.
,
Grigorenko Bella L.
,
Savitsky Alexander P.
,
Nemukhin Alexander V.
в журнале
Journal of Physical Chemistry B
, издательство
American Chemical Society
(United States)
, том 117, № 43, с. 13507-13514
DOI
2012
Exploring Structural and Optical Properties of Fluorescent Proteins by Squeezing: Modeling High-Pressure Effects on the mStrawberry and mCherry Red Fluorescent Proteins
Laurent Adele D.
,
Mironov Vladimir A.
,
Chapagain Prem P.
,
Nemukhin Alexander V.
,
Krylov Anna I.
в журнале
Journal of Physical Chemistry B
, издательство
American Chemical Society
(United States)
, том 116, № 41, с. 12426-12440
DOI
2012
Modeling absorption of the kindling fluorescent protein with the neutral form of the chromophore
Topol Igor
,
Collins Jack
,
Mironov Vladimir
,
Savitsky Alexander
,
Nemukhin Alexander
в журнале
International Journal of Quantum Chemistry
, издательство
John Wiley & Sons Inc.
(United States)
, том 112, № 17, с. 2947-2959
DOI
2011
Conformational Partitioning in pH-Induced Fluorescence of the Kindling Fluorescent Protein (KFP)
Rusanov Alexander L.,
Mironov Vladimir A.
,
Goryashenko Alexander S.
,
Grigorenko Bella L.
,
Nemukhin Alexander V.
,
Savitsky Alexander P.
в журнале
Journal of Physical Chemistry B
, издательство
American Chemical Society
(United States)
, том 115, № 29, с. 9195-9201
DOI
2011
The origin of radiationless conversion of the excited state in the kindling fluorescent protein (KFP): femtosecond studies and quantum modeling
Shelaev I.
,
Mironov Vladimir A.
, Rusanov A., Gostev F.,
Bochenkova A.
,
Sarkisov O.
,
Nemukhin A.
,
Savitsky A.
в журнале
Laser Physics Letters
, издательство
Wiley - VCH Verlag GmbH & CO. KGaA
(Germany)
, том 8, № 6, с. 469-474
DOI
Статьи в сборниках
2021
Multi-Level Parallelization of the Fragment Molecular Orbital Method in GAMESS
Mironov Vladimir A.
,
Alexeev Yuri
,
Fedorov Dmitri G.
,
Umeda Hiroaki
,
Pruitt Spencer
,
Gaenko Alexander
,
Gordon Mark S.
в сборнике
Recent Advances of the Fragment Molecular Orbital Method
, издательство
Springer Singapore
(Singapore)
, с. 601-616
DOI
2020
Computational Methods for Biochemical Simulations Implemented in GAMESS
Fedorov Dmitri G.
,
Hui Li
,
Mironov Vladimir
,
Alexeev Yuri
в сборнике
Quantum Mechanics in Drug Discovery
, серия
Methods in Molecular Biology (Methods and Protocols)
, место издания
Springer US Humana, New York, NY
, том 2114, с. 123-142
DOI
2019
The Parallel Hydrodynamic Code for Astrophysical Flow with Stellar Equations of State
Kulikov Igor
,
Chernykh Igor
,
Vshivkov Vitaly
,
Prigarin Vladimir
,
Mironov Vladimir
, Tutukov Alexander
в сборнике
Supercomputing
, серия
Communications in Computer and Information Science (CCIS)
, место издания
Springer International Berlin
, том 965, с. 414-426
DOI
2017
An Efficient MPI/openMP Parallelization of the Hartree-Fock Method for the Second Generation of Intel Xeon Phi Processor
Mironov Vladimir
,
Alexeev Yuri
,
Keipert Kristopher
,
D’mello Michael
,
Moskovsky Alexander
,
Gordon Mark S.
в сборнике
Proceedings of the International Conference for High Performance Computing, Networking, Storage and Analysis
, серия
SC’17
, место издания
ACM New York, NY, USA
, с. 39:1-39:12
DOI
2017
Зеленый флуоресцентный белок: от рождения до смерти
Григоренко Б.Л.
,
Поляков И.В.
,
Миронов В.А.
,
Немухин А.В.
в сборнике
Суперкомпьютерные технологии в науке, образовании и промышленности / Под редакцией: академика В.А. Садовничего, академика Г.И. Савина, чл.-корр. РАН Вл.В. Воеводина
, серия
Суперкомпьютерное образование
, место издания
Издательство Московского университета Москва
, том 7, с. 33-44
Доклады на конференциях
2021
Open Quantum Project
(Приглашенный)
Автор:
Mironov Vladimir
NHISS2021: Light-Matter Interaction: Theory meets Experiment
, Jeju, Корея, Республика, 22-25 ноября 2021
2021
Applying joint theoretical-experimental research to aptamer modeling
(Устный)
Авторы:
Щугорева Ирина Андреевна
,
Морозов Дмитрий Иванович
,
Миронов Владимир Андреевич
Цифровые управляемые лекарства на стыке наук
, г. Красноярск, Россия, Россия, 18 марта 2021
2021
Computional approach to design of aptamers to the receptor-binding domain of SARS-COV-2
(Устный)
Авторы:
Артюшенко Полина Владимировна
,
Миронов Владимир Андреевич
,
Nicola Borbone
,
Морозов Дмитрий Иванович
Цифровые управляемые лекарства на стыке наук
, г. Красноярск, Россия, Россия, 18 марта 2021
2019
MPI+OpenMP Paralelization of Density Functional Theory Method in GAMESS
(Стендовый)
Авторы:
Vladimir Mironov
,
Yuri Alexeev
,
Fedorov Dmitri G.
SC19: The International Conference for High Performance Computing, Networking, Storage, and Analysis
, Denver (CO), США, 17-22 ноября 2019
2019
Опыт быстрого развертывания облачной вычислительной среды для обработки научных данных
(Стендовый)
Авторы:
Московский А.A.
,
Миронов В.А.
,
Брехов А.Т.
,
Хренова М.Г.
,
Поляков И.В.
,
Фирсов Д.А.
,
Немухин А.В.
,
Подгайный Д.В.
, Стрельцова О.И.
Russian Supercomputing Days
, Москва, Россия, 23-24 сентября 2019
2019
Молекулярное моделирование ковалентного связывания биливердина в белке miRFP670
(Стендовый)
Авторы:
Миронов В.А.
,
Григоренко Б.Л.
,
Кулакова А.М.
,
Хренова М.Г.
I Конференция с международным участием "Физическая химия в России и за рубежом: от квантовой химии до эксперимента"
, Черноголовка, Россия, 16-20 июня 2019
2019
От молекулярного моделирования механизмов ферментативных реакций до стационарной кинетики Михаэлиса-Ментен
(Устный)
Авторы:
Хренова М.Г.
,
Миронов В.А.
,
Немухин А.В.
,
Григоренко Б.Л.
,
Поляков И.В.
«Взаимосвязь ионных и ковалентных взаимодействий в дизайне молекулярных и наноразмерных химических систем» (ChemSci-2019)
, Институт органической химии им. Н.Д. Зелинского Российской академии наук (ИОХ РАН), Россия, 13-17 мая 2019
2018
MPI/OpenMP Parallelization of the Fragment Molecular Orbital Method in GAMESS
(Стендовый)
Авторы:
Vladimir Mironov
,
Yuri Alexeev
,
Fedorov Dmitri G.
SC18: The International Conference for High Performance Computing, Networking, Storage, and Analysis
, Dallas (TX), США, 11-16 ноября 2018
2018
The Parallel Hydrodynamic Code for Astrophysical Flow with Stellar Equations of State
(Устный)
Авторы:
Igor Chernykh
,
Igor Kulikov
,
Alexander Tutukov
,
Vladimir Prigarin
,
Vladimir Mironov
,
Vitaly Vshivkov
Международная конференция "Суперкомпьютерные дни в России 2018"
, Москва, Россия, 24-25 сентября 2018
2018
Суперкомпьютерное моделирование структуры и спектров фитохромов
(Стендовый)
Авторы:
Поляков Игорь Вадимович
,
Миронов Владимир Александрович
,
Немухин Александр Владимирович
,
Григоренко Белла Людвиговна
,
Московский Александр Александрович
Суперкомпьютерные дни в России
, Москва, Россия, 24-25 сентября 2018
2018
PaSTRI: Error-Bounded Lossy Compression for Two-Electron Integrals in Quantum Chemistry
(Устный)
Авторы:
Ali Murat Gok
,
Sheng Di
,
Yuri Alexeev
,
Dingwen Tao
,
Vladimir Mironov
,
Xin Liang
,
Franck Cappello
IEEE International Conference on Cluster Computing 2018 (CLUSTER'18)
, Belfast, Великобритания, 10-13 сентября 2018
2017
An efficient MPI/OpenMP parallelization of the Hartree-Fock method for the second generation of Intel Xeon Phi processor
(Устный)
Авторы:
Vladimir Mironov
,
Yuri Alexeev
,
Kristopher Keipert
,
Michael D'mello
,
Alexander Moskovsky
,
Gordon Mark S.
SC17: International Conference for High Performance Computing, Networking, Storage and Analysis
, Denver, CO, США, 12-17 ноября 2017
2017
PaSTRI: A Novel Data Compression Algorithm for Two-Electron Integrals in Quantum Chemistry
(Стендовый)
Авторы:
Ali Murat Gok
,
Dingwen Tao
,
Sheng Di
,
Vladimir Mironov
,
Yuri Alexeev
,
Franck Cappello
SC17: International Conference for High Performance Computing, Networking, Storage and Analysis
, Denver, CO, США, 12-17 ноября 2017
2017
Benefits of Intel Memory Drive Technology for Scientific Applications
(Устный)
Авторы:
Yuri Alexeev
,
Andrey Kudryavtsev
,
Igor Chernykh
,
Vladimir Mironov
Intel HPC Developer Conference 2017
, Denver, CO, США, 11-12 ноября 2017
2017
Введение в вычислительную химию и параллельные вычисления. Практические применения для больших молекулярных систем
(Приглашенный)
Авторы:
Поляков И.В.
,
Миронов В.А.
Летняя школа «Высокопроизводительные вычисления в химии»
, Новосибирск, Россия, 27-28 июня 2017
2017
Введение в вычислительную химию и параллельные вычисления. Теоретические аспекты.
(Приглашенный)
Авторы:
Поляков И.В.
,
Миронов В.А.
Летняя школа «Высокопроизводительные вычисления в химии»
, Новосибирск, Россия, 27-28 июня 2017
2017
Optimization of Special Functions for Quantum Chemistry
(Стендовый)
Авторы:
Moskovsky A.A.
,
Mironov V.A.
ISC High Performance 2017
, Франкфурт-на-Майне, Германия, 18-22 июня 2017
2017
Квантовая химия - от основ к практическим высокопроизводительным вычислениям на базе программного пакета GAMESS (US)
(Приглашенный)
Авторы:
Поляков И.В.
,
Московский А.А.
,
Миронов В.А.
Intel IXPUG/RU 2017
, Российская академия наук. г. Москва, Ленинский проспект 32А, Россия, 1-2 июня 2017
2017
Power Measurements of Hartree-Fock Algorithms Using Different Storage Devices
(Устный)
Авторы:
Vladimir Mironov
,
Alexander Moskovsky
,
Yuri Alexeev
HPPAC: 13th Workshop on High-Performance, Power-Aware Computing
, Orlando, Florida, США, 29 мая 2017
2017
Special functions in quantum chemistry
(Устный)
Авторы:
Vladimir Mironov
,
Alexander Moskovsky
IXPUG Annual Spring Conference 2017
, Cambridge, Великобритания, 10-13 апреля 2017
2016
Quantum chemistry code optimization for Intel MIC architecture
(Приглашенный)
Автор:
Vladimir Mironov
Intel HPC DevCon 2016 India
, Hyderabad, Индия, 16-17 декабря 2016
2016
Особенности переноса и применения пакета GAMESS (US) на Intel® Xeon Phi™
(Устный)
Автор:
Владимир Миронов
Работа реальных приложений на процессоре Intel® Xeon Phi™ 7200: подход, опыт и результаты
, Москва, Россия, 26 сентября 2016
2016
Efficient MPI/OpenMP Parallelization of the Hartree-Fock Method on Intel® Xeon Phi Processors
(Устный)
Авторы:
Michael D'Mello
,
Vladimir Mironov
,
Yuri Alexeev
,
Alexander Moskovsky
IXPUG 2016 Annual US Meeting (IXPUG2016)
, Argonne, IL, США, 19-22 сентября 2016
2016
High Temperature Coolant Demonstrated for a Computational Cluster
(Устный)
Авторы:
Egor Druzhinin
,
Alexey Shmelev
,
Andrey Semin
,
Yuri Migal
,
Vladimir Mironov
,
Alexander Moskovsky
International Workshop on Optimization of Energy Efficient HPC & Distributed Systems (OPTIM 2016)
, Innsbruck, Австрия, 18-22 июля 2016
2016
Optimization of electron repulsion integral calculations in the quantum chemistry package GAMESS
(Стендовый)
Авторы:
Alexander Moskovsky
,
Vladimir Mironov
ISC High Performance
, Франкфурт на Майне , Германия, 19-23 июня 2016
2016
Parallelization and optimization of Hartree-Fock method in GAMESS-US quantum chemistry code
(Устный)
Авторы:
Alexander Moskovsky
,
Vladimir Mironov
IXPUG/EMEA Conference 2016
, Ostrava, Чехия, 14-18 марта 2016
2016
Механизм реакции гидролиза гуанозинтрифосфата в белковом комплексе Arl3-RP2 по результатам молекулярного моделирования
(Устный)
Авторы:
Коц Е.Д.
,
Хренова М.Г.
,
Григоренко Б.Л.
,
Миронов В.А.
МАТЕМАТИКА. КОМПЬЮТЕР. ОБРАЗОВАНИЕ. МКО-2016
, Дубна, Россия, 25-30 января 2016
2015
GTP hydrolysis by Ras-GAP enzymatic complex: a theoretical study
(Стендовый)
Авторы:
Leonora Lychko
,
Alexander Nemukhin
,
Vladimir Mironov
,
Nikolay Anuchin
51st Symposium on Theoretical Chemistry
, Potsdam, Германия, 20-24 сентября 2015
2015
Моделирование реакции гидролиза гуанозинтрифосфата в белковом комплексе Arl3-RP2
(Устный)
Авторы:
Хренова М.Г.
,
Миронов В.А.
,
Кулакова А.М.
XXVII Симпозиум “Современная химическая физика” (20 сентября - 1 октября 2015 г., г. Туапсе)
, Туапсе, Россия, 20 сентября - 1 октября 2015
2015
Молекулярно-динамическое исследование гидролиза гуанозинтрифосфата (ГТФ) белковым комплексом Ras-GAP
(Устный)
Авторы:
Миронов В.А.
,
Немухин А.В.
,
Лычко Л.А.
XXVII Симпозиум “Современная химическая физика” (20 сентября - 1 октября 2015 г., г. Туапсе)
, Туапсе, Россия, 20 сентября - 1 октября 2015
2015
Adaptation of the Hartree-Fock method in GAMESS (US) to Intel Xeon Phi architecture
(Устный)
Авторы:
Moskovsky Alexander A.
,
Mironov Vladimir A.
International Conference on Computer Simulation in Physics and beyond (CSP 2015)
, Moscow, Россия, 6-10 сентября 2015
2015
On Quantum Chemistry Code Adaptation for RSC PetaStream Architecture
(Устный)
Авторы:
Mironov Vladimir
,
Moskovsky Alexander
,
Khrenova Maria
ISC High Performance
, Франкфурт, Германия, 12-16 июля 2015
2015
Modeling GTP hydrolysis in Ras-GAP
(Устный)
Авторы:
Khrenova Maria
,
Mironov Vladimir
,
Nemukhin Alexander
International Conference "Biocatalysis-2015: Fundamentals and Applications", Moscow region, Avantel Club Istra
, Moscow region, Avantel Club Istra, Россия, 21-26 июня 2015
2015
Computational study of the GTP hydrolysis by the Ras-GAP protein complex
(Стендовый)
Авторы:
Khrenova M.G.
,
Nemukhin A.V.
,
Mironov V.A.
,
Lychko L.A.
The 15th International Congress of Quantum Chemistry
, Пекин, Китай, 8-13 июня 2015
2014
Modeling of Chemical Transformations in GTPase Active Sites upon GTP Hydrolysis
(Устный)
Авторы:
Maria Khrenova
,
Leonora Lychko
,
Vladimir Mironov
,
Alexander Nemukhin
GTPases: Mechanisms, Interactions and Applications
, Suzhou, China, Китай, 2014
2014
Simulations of Proton Transfer Routes in Proteins of the Green Fluorescent Protein Family
(Не указан)
Авторы:
Alexander Nemukhin
,
Vladimir Mironov
,
Bella Grigorenko
248th American Chemical Society National Meeting & Exposition
, San Francisco, CA, USA, США, 2014
2014
The Performance Characterization of the RSC PetaStream Module
(Устный)
Авторы:
Druzhinin Egor
,
Semin Andrey
,
Mironov Vladimir
,
Moskovsky Alexander
,
Shmelev Alexey
The International Supercomputing Conference: High Performance 2014
, Leipzig, Германия, 22-26 июня 2014
2013
Photocycle of the photoswitchable fluorescent protein asCP
(Стендовый)
Авторы:
Миронов В.А.
,
Немухин А.В.
,
Хренова М.Г.
,
Боченкова А.В.
11th EUROPEAN CONFERENCE ON ATOMS, MOLECULES AND PHOTONS (ECAMP11)
, Aarhus, Denmark, Дания, 2013
2013
Photoswitching of the kindiling fluorescent protein: a theoretical study
(Стендовый)
Авторы:
Mironov Vladimir A.
,
Nemukhin Alexander V.
,
Khrenova Maria G.
,
Bochenkova Anastasia V.
VIII Congress of International Society of Theoretical Chemical Physics
, Budapest, Hungary, Венгрия, 2013
2011
Non-covalent interactions influence on asCP chromophore absorption spectra
(Стендовый)
Авторы:
Миронов В.А.
,
Немухин А.В.
,
Боченкова А.В.
XIX Conference on Horizons in Hydrogen Bond Research
, Göttingen, Germany, Германия, 2011
2011
Photophysical properties of the kindling fluorescent protein
(Стендовый)
Авторы:
Боченкова А.В.
,
Миронов В.А.
,
Немухин А.В.
Ninth Triennial Congress of the WORLD ASSOCIATION OF THEORETICAL AND COMPUTATIONAL CHEMISTS WATOC 2011
, Santiago de Compostela, Spain, Испания, 2011
2010
Изучение механизма биосинтеза хромофора зеленого флуоресцентного белка
(Стендовый)
Авторы:
Миронов В.А.
,
Немухин А.В.
,
Боченкова А.В.
XXII симпозиум «Современная химическая физика»
, Туапсе, Россия, Россия, 24 сентября - 5 октября 2010
2010
Theoretical study of the GFP chromophore biosynthesis
(Стендовый)
Авторы:
Немухин А.В.
,
Боченкова А.В.
,
Миронов В.А.
8th European Conference on Computational Chemistry
, Lund, Sweden, Швеция, 25-28 августа 2010
Тезисы докладов
2019
Evaluation of Intel Memory Drive Technology Performance for Computational Astrophysics
Chernykh Igor
,
Mironov Vladimir
,
Kudryavtsev Andrey
,
Kulikov Igor
в сборнике
Supercomputing. RuSCDays 2019
, серия
Communications in Computer and Information Science (CCIS)
, место издания
Springer Cham, Switzerland
, том 1128, тезисы, с. 563-572
DOI
2019
Performance Evaluation of the Intel Optane DC Memory With Scientific Benchmarks
Vladimir Mironov
,
Igor Chernykh
,
Igor Kulikov
,
Alexander Moskovsky
, Evgeny Epifanovsky,
Andrey Kudryavtsev
в сборнике
Proceedings of 2019 IEEE/ACM Workshop on Memory Centric High Performance Computing (MCHPC)
, тезисы, с. 1-6
DOI
2019
Молекулярное моделирование ковалентного связывания биливердина в белке miRFP670
Кулакова А.М.
,
Григоренко Б.Л.
,
Миронов В.А.
,
Хренова М.Г.
в сборнике
Книга тезисов "1ая Конференция с международным участием "Физическая химия в России и за рубежом: от квантовой химии до эксперимента""
, место издания
ISBN 978-5-4465-2339-9
, тезисы, с. 24-25
2019
От молекулярного моделирования механизмов ферментативных реакций до стационарной кинетики Михаэлиса-Ментен
Хренова М.Г.
,
Миронов В.А.
,
Поляков И.В.
,
Григоренко Б.Л.
,
Немухин А.В.
в сборнике
Сборник тезисов Всероссийская конференция "Взаимосвязь ионных и ковалентных взаимодействий в дизайне молекулярных и наноразмерных химических систем"
, серия
ISBN 978-5-6041187-6-4
, тезисы, с. 80-80
2018
Evaluation of Intel Memory Drive Technology Performance for Scientific Applications
Mironov Vladimir
,
Kudryavtsev Andrey
,
Alexeev Yuri
,
Moskovsky Alexander
,
Kulikov Igor
,
Chernykh Igor
в сборнике
Proceedings of the Workshop on Memory Centric High Performance Computing
, серия
MCHPC’18
, место издания
ACM New York, NY, USA
, тезисы, с. 14-21
DOI
2018
PaSTRI: Error-Bounded Lossy Compression for Two-Electron Integrals in Quantum Chemistry
Gok A.M.
,
Di S.
,
Alexeev Y.
,
Tao D.
,
Mironov V.
,
Liang X.
,
Cappello F.
в сборнике
2018 IEEE International Conference on Cluster Computing (CLUSTER)
, тезисы, с. 1-11
DOI
2018
The Parallel Hydrodynamic Code for Astrophysical Flow with Stellar Equations of State
Igor Kulikov
,
Igor Chernykh
,
Vitaly Vshivkov
,
Vladimir Prigarin
,
Vladimir Mironov
,
Alexander Tutukov
в сборнике
Суперкомпьютерные дни в России: Труды международной конференции (24-25 сентября 2018 г., г. Москва)
, место издания
М.: Изд-во МГУ
, тезисы, с. 612-624
2017
Power Measurements of Hartree-Fock Algorithms Using Different Storage Devices
Mironov Vladimir
,
Moskovsky Alexander
,
Alexeev Yuri
в сборнике
2017 IEEE International Parallel and Distributed Processing Symposium Workshops (IPDPSW)
, место издания
IEEE
, тезисы, с. 1004-1011
DOI
2016
High temperature coolant demonstrated for a computational cluster
Druzhinin E.
,
Shmelev A.
,
Moskovsky A.
,
Migal Y.
,
Mironov V.
,
Semin A.
в сборнике
2016 International Conference on High Performance Computing and Simulation, HPCS 2016
, тезисы, с. 814-817
DOI
2015
On Quantum Chemistry Code Adaptation for RSC PetaStream Architecture
Mironov Vladimir
,
Khrenova Maria
,
Moskovsky Alexander
в сборнике
High Performance Computing
, серия
Lecture Notes in Computer Science
, место издания
Springer International Publishing
, том 9137, тезисы, с. 113-121
DOI
2014
The Performance Characterization of the RSC PetaStream Module
Semin Andrey
,
Druzhinin Egor
,
Mironov Vladimir
,
Shmelev Alexey
,
Moskovsky Alexander
в сборнике
Supercomputing
, серия
Lecture Notes in Computer Science
, место издания
Springer International Publishing
, том 8488, тезисы, с. 420-429
DOI
2012
Fluorescent properties of the kindling fluorescent protein (KFP) at acidic pH values
Goryashchenko A.S.
,
Rusanov A.L.
,
Mironov V.A.
,
Nemukhin A.V.
,
Savitsky A.P.
в сборнике
Proceedings of the International Conference on Advanced Laser Technologies
, место издания
Open Publishing Bern
, том 1, тезисы
DOI
НИРы
1 января 2021 - 31 декабря 2024
Строение и динамика атомно-молекулярных систем
Кафедра физической химии
Руководитель:
Немухин А.В.
Ответственные исполнители:
Безруков Д.С.
,
Хренова М.Г.
Участники НИР:
Абраменков А.В.
,
Андронова Т.А.
,
Батаев В.А.
,
Бедняков А.С.
,
Белега Е.Д.
,
Белов А.С.
,
Богдашин В.А.
,
Бохан Д.А.
,
Боченкова А.В.
,
Волынкина И.А.
,
Глебов И.О.
,
Годунов И.А.
,
Головкин А.В.
,
Голосная М.Н.
,
Григоренко Б.Л.
,
Давыдова И.Б.
,
Домрачева Т.М.
,
Духовских Е.А.
,
Емельянова М.А.
,
Еремин В.В.
,
Ермилов А.Ю.
,
Занина А.А.
,
Зареченская А.С.
,
Исаева Е.В.
,
Кабылда А.М.
,
Капуста Д.П.
,
Клещина Н.Н.
,
Князева М.А.
,
Козлов М.И.
,
Козлов С.В.
,
Корнейчук А.Я.
,
Королева Л.А.
,
Кочергина И.Ю.
,
Краснощеков С.В.
,
Кузьменко Н.Е.
,
Кулакова А.М.
,
Курамшина Г.М.
,
Лазарев А.В.
,
Ларин А.В.
,
Максимов С.В.
,
Марина В.И.
,
Маслов Д.В.
,
Метелешко Ю.И.
,
Миронов В.А.
,
Московский А.А.
,
Мулашкина Т.И.
,
Никитина Н.А.
,
Осин С.Б.
,
Пазюк Е.А.
,
Петров С.В.
,
Пичугина Д.А.
,
Поддубный В.В.
,
Поляков И.В.
,
Родин В.А.
,
Руденко А.Ю.
,
Рыбаков А.А.
,
Рыжова О.Н.
,
Сенявин В.М.
,
Степанов Н.Ф.
,
Сызганцева О.А.
,
Татаренко К.А.
,
Терашкевич В.А.
,
Трубников Д.Н.
,
Уркунова Т.А.
,
Устынюк Л.Ю.
,
Финенко А.А.
,
Хохлов Д.В.
,
Хрустов В.Ф.
,
Чистиков Д.Н.
,
Шепелев Н.М.
,
Шляпина В.Л.
,
Щербинин А.В.
,
Яковлев Н.Н.
1 января 2020 - 31 декабря 2021
Моделирование строения и свойств биомолекул для многоцветной флуоресцентной визуализации в живых системах
НИЛ квантовой химии и молекулярного моделирования
Руководитель:
Григоренко Б.Л.
Ответственный исполнитель:
Хренова М.Г.
Участники НИР:
Домрачева Т.М.
,
Захарова Т.М.
,
Капуста Д.П.
,
Кулакова А.М.
,
Метелешко Ю.И.
,
Миронов В.А.
,
Мулашкин Ф.Д.
,
Поляков И.В.
1 марта 2019 - 30 декабря 2022
Суперкомпьютерное моделирование биомолекулярных систем на основе квантово-химических и молекулярно-динамических методов: от ферментативного катализа до оптогенетики
ИБХФ РАН
Руководитель:
Немухин А.В.
Ответственные исполнители:
Коц Е.Д.
,
Лущекина С.В.
,
Московский А.А.
Участники НИР:
Григоренко Б.Л.
,
Лычко Л.А.
,
Миронов В.А.
,
Поляков И.В.
1 декабря 2017 - 30 ноября 2018
Модернизация пакета квантовой химии GAMESS для проведения высокопараллельных расчетов
НИЛ химической кибернетики
Руководитель:
Миронов В.А.
Ответственный исполнитель:
Московский А.А.
Участники НИР:
Немухин А.В.
,
Поляков И.В.
,
Хренова М.Г.
16 апреля 2017 - 28 декабря 2018
Суперкомпьютерное моделирование молекулярного полиморфизма ферментов человека
ИБХФ РАН
Руководитель:
Немухин А.В.
Ответственный исполнитель:
Московский А.А.
Участники НИР:
Григоренко Б.Л.
,
Коц Е.Д.
,
Кулакова А.М.
,
Лычко Л.А.
,
Миронов В.А.
,
Поляков И.В.
,
Хренова М.Г.
1 января 2017 - 31 декабря 2019
Моделирование строения и свойств биомолекул для многоцветной флуоресцентной визуализации в живых системах
Кафедра физической химии
Руководитель:
Григоренко Б.Л.
Ответственный исполнитель:
Хренова М.Г.
Участники НИР:
Капуста Д.П.
,
Коц Е.Д.
,
Кулакова А.М.
,
Лычко Л.А.
,
Метелешко Ю.И.
,
Миронов В.А.
,
Поляков И.В.
28 ноября 2016 - 15 ноября 2017
Модернизация пакета квантовой химии GAMESS для проведения высокопараллельных расчетов
Кафедра физической химии
Руководитель:
Миронов В.А.
Ответственный исполнитель:
Московский А.А.
Участники НИР:
Немухин А.В.
,
Поляков И.В.
,
Хренова М.Г.
1 января 2016 - 31 декабря 2020
Строение и динамика атомно-молекулярных систем
Кафедра физической химии
Руководители:
Немухин А.В.
,
Степанов Н.Ф.
Ответственный исполнитель:
Безруков Д.С.
Участники НИР:
Абраменков А.В.
,
Абрамович А.И.
,
Агеев Г.Г.
,
Адамсон С.О.
,
Алексеев Е.С.
,
Альтова Е.П.
,
Банару А.М.
,
Батаев В.А.
,
Баум Е.А.
,
Бедняков А.С.
,
Безруков Д.С.
,
Белега Е.Д.
,
Белов А.С.
,
Белова М.В.
,
Богатова Т.В.
,
Богдан Т.В.
,
Бохан Д.А.
,
Боченкова А.В.
,
Бучаченко А.А.
,
Вилкова А.Л.
,
Глебов И.О.
,
Годунов И.А.
,
Головкин А.В.
,
Григоренко Б.Л.
,
Грикина О.Е.
,
Гринева О.В.
,
Давыдова И.Б.
,
Дмитриенко А.О.
,
Дорофеева О.В.
,
Еремин В.В.
,
Ермилов А.Ю.
,
Засурская Л.А.
,
Захарова Т.М.
,
Иванов А.А.
,
Исаева Е.В.
,
Капуста Д.П.
,
Клещина Н.Н.
,
Князева М.А.
,
Ковтун Д.М.
,
Колесникова И.Н.
,
Королева Л.А.
,
Коц Е.Д.
,
Крамаренко С.С.
,
Краснощеков С.В.
,
Кузьменко Н.Е.
,
Кулакова А.М.
,
Курамшина Г.М.
,
Лазарев А.В.
,
Ланшина Л.В.
,
Ларин А.В.
,
Лысенко К.А.
,
Львова Е.Ю.
,
Майорова А.Ф.
,
Макухин Н.Н.
,
Марочкин И.И.
,
Миронов В.А.
,
Митин А.В.
,
Моисеева Н.Ф.
,
Московский А.А.
,
Немухин А.В.
,
Новаковская Ю.В.
,
Осин С.Б.
,
Пазюк Е.А.
,
Панченко Ю.Н.
,
Петров С.В.
,
Пичугина Д.А.
,
Поддубный В.В.
,
Поляков И.В.
,
Прибытков А.В.
,
Пупышев В.И.
,
Рыбаков А.А.
,
Рыжова О.Н.
,
Рыков А.Н.
,
Сенявин В.М.
,
Словохотов Ю.Л.
,
Степанов Н.Ф.
,
Степанова А.В.
,
Татаренко К.А.
,
Терентьев Р.В.
,
Тихонов Д.С.
,
Трубников Д.Н.
,
Тукачев Н.В.
,
Устынюк Л.Ю.
,
Филимонова М.А.
,
Хайкин Л.С.
,
Хренова М.Г.
,
Христенко Л.В.
,
Хрустов В.Ф.
,
Чемлева Т.А.
,
Шергольд И.А.
,
Шишков И.Ф.
,
Щербинин А.В.
,
Яковлев Н.Н.
1 января 2016 - 31 декабря 2018
Молекулярное моделирование механизмов химических реакций в цинк-зависимых ферментах
Кафедра физической химии
Руководитель:
Григоренко Б.Л.
Участники НИР:
Капуста Д.П.
,
Князева М.А.
,
Кулакова А.М.
,
Лычко Л.А.
,
Миронов В.А.
,
Хренова М.Г.
1 августа 2015 - 31 июля 2016
Разработка оптимизированной для архитектуры Intel MIC версии программного пакета GAMESS (US)
Кафедра физической химии
Руководитель:
Миронов В.А.
Участники НИР:
Московский А.А.
,
Немухин А.В.
,
Хренова М.Г.
12 мая 2015 - 31 декабря 2016
Квантово-химическое моделирование таутомерных превращений аминокислотных остатков с карбоксамидной функциональной группой - аспарагина и глютамина
Кафедра физической химии
Руководитель:
Хренова М.Г.
Участники НИР:
Григоренко Б.Л.
,
Коц Е.Д.
,
Кулакова А.М.
,
Миронов В.А.
,
Поляков И.В.
1 июля 2014 - 1 июля 2015
Разработка оптимизированной для архитектуры Intel MIC версии программного пакета GAMESS (US)
Кафедра физической химии
Руководитель:
Миронов В.А.
Участники НИР:
Московский А.А.
,
Немухин А.В.
,
Хренова М.Г.
31 января 2014 - 31 декабря 2016
Сверхбыстрая неадиабатическая динамика биологических хромофоров
Кафедра физической химии
Руководитель:
Боченкова А.В.
Участники НИР:
Грановский А.А.
,
Лычко Л.А.
,
Миронов В.А.
,
Поляков И.В.
,
Хренова М.Г.
1 января 2014 - 31 декабря 2016
Суперкомпьютерное моделирование молекулярного полиморфизма ферментов человека
ИБХФ РАН
Руководитель:
Немухин А.В.
Участники НИР:
Григоренко Б.Л.
,
Коц Е.Д.
,
Кулакова А.М.
,
Лычко Л.А.
,
Миронов В.А.
,
Московский А.А.
,
Новичкова Д.А.
,
Поляков И.В.
,
Хренова М.Г.
1 января 2014 - 31 декабря 2015
Новые биофизические и структурные аспекты молекулярных процессов в фотосинтетических центрах
Кафедра физической химии
Руководитель:
Немухин А.В.
Участники НИР:
Григоренко Б.Л.
,
Миронов В.А.
,
Новичкова Д.А.
,
Поляков И.В.
,
Хренова М.Г.
1 января 2014 - 31 декабря 2015
Развитие и применение компьютерных методов расчета поверхностей свободной энергии для химических реакций в белках на основе молекулярно-динамических подходов с квантовыми силами
Кафедра физической химии
Руководитель:
Миронов В.А.
Участники НИР:
Губайдуллина А.М.
,
Кулакова А.М.
,
Новичкова Д.А.
1 января 2013 - 31 декабря 2015
Моделирование химических реакций в цветных белках методами квантовой теории
ИБХФ РАН
Руководитель:
Немухин А.В.
Участники НИР:
Григоренко Б.Л.
,
Миронов В.А.
,
Московский А.А.
1 января 2011 - 31 декабря 2015
Строение и динамика атомно-молекулярных систем
Кафедра физической химии
Руководитель:
Степанов Н.Ф.
Участники НИР:
Абраменков А.В.
,
Абрамович А.И.
,
Адамсон С.О.
,
Аксенов С.М.
,
Алексеев Е.С.
,
Альтова Е.П.
,
Банару А.М.
,
Батаев В.А.
,
Баум Е.А.
,
Безруков Д.С.
,
Белега Е.Д.
,
Белов А.С.
,
Белова М.В.
,
Богатова Т.В.
,
Богдан Т.В.
,
Бохан Д.А.
,
Боченкова А.В.
,
Бучаченко А.А.
,
Вилкова А.Л.
,
Воронцов А.В.
,
Глебов И.О.
,
Годунов И.А.
,
Головкин А.В.
,
Григоренко Б.Л.
,
Грикина О.Е.
,
Гринева О.В.
,
Давыдова И.Б.
,
Дорофеева О.В.
,
Еремин В.В.
,
Ермилов А.Ю.
,
Засурская Л.А.
,
Иванов А.А.
,
Исаева Е.В.
,
Карасев Н.М.
,
Князева М.А.
,
Ковтун Д.М.
,
Колесникова И.Н.
,
Королева Л.А.
,
Коц Е.Д.
,
Крамаренко С.С.
,
Краснощеков С.В.
,
Кузьменко Н.Е.
,
Курамшина Г.М.
,
Лазарев А.В.
,
Ланшина Л.В.
,
Ларин А.В.
,
Львова Е.Ю.
,
Майорова А.Ф.
,
Макухин Н.Н.
,
Макухин Н.Н.
,
Марочкин И.И.
,
Миронов В.А.
,
Митин А.В.
,
Моисеева Н.Ф.
,
Московский А.А.
,
Немухин А.В.
,
Новаковская Ю.В.
,
Осин С.Б.
,
Пазюк Е.А.
,
Панченко Ю.Н.
,
Петров С.В.
,
Пичугина Д.А.
,
Прибытков А.В.
,
Пупышев В.И.
,
Рыбаков А.А.
,
Рыжова О.Н.
,
Рыков А.Н.
,
Сенявин В.М.
,
Серебренников Л.В.
,
Словохотов Ю.Л.
,
Степанова А.В.
,
Татаренко К.А.
,
Терентьев Р.В.
,
Трубников Д.Н.
,
Тукачев Н.В.
,
Филимонова М.А.
,
Хайкин Л.С.
,
Хренова М.Г.
,
Христенко Л.В.
,
Хрустов В.Ф.
,
Чемлева Т.А.
,
Шергольд И.А.
,
Шишков И.Ф.
,
Щербинин А.В.
,
Яковлев Н.Н.
1 января 2011 - 31 декабря 2013
Моделирование механизмов формирования флуоресцентных белков и первичных фотохимических процессов в функционировании биологических хромофоров
Кафедра физической химии
Руководитель:
Боченкова А.В.
Участники НИР:
Андрийченко Н.Н.
,
Грановский А.А.
,
Миронов В.А.
,
Новичкова Д.А.
,
Хренова М.Г.
1 января 2010 - 31 декабря 2011
Механизмы и динамика первичных процессов релаксации в функционировании биологических фоторецепторов и флуоресцентных белков
Кафедра физической химии
Руководитель:
Боченкова А.В.
Участники НИР:
Миронов В.А.
,
Хренова М.Г.
Награды и премии
2018
Overall best paper award on IEEE Cluster 2018 conference
Лауреаты:
Gok A.M.
,
Di S.
,
Alexeev Y.
,
Tao D.
,
Mironov V.
,
Liang X.
,
Cappello F.
Queen's University Belfast, Великобритания
2016
Победитель конкурса проектов пользователей СКЦ МГУ 2016 г
Лауреаты:
Хренова М.Г.
,
Миронов В.А.
МГУ, Россия
Членство в научных обществах
с 2017
Associaton for Computing Machinery (ACM)
США
Диссертация
2013
Моделирование структуры и спектров красных флуоресцентных белков методами квантовой химии и молекулярной динамики
Кандидатская диссертация по специальности 02.00.17 - Математическая и квантовая химия (физ.-мат. науки)
Автор:
Миронов Владимир Андреевич
, к.ф.-м.н., МГУ имени М.В. Ломоносова
Научный руководитель:
Немухин А.В.
, д.х.н., проф., МГУ имени М.В. Ломоносова
Защищена в совете
Д 501.001.50
при МГУ имени М.В. Ломоносова, Химический факультет
Организация, в которой выполнялась работа:
МГУ имени М.В. Ломоносова
Руководство дипломными работами
2019
Расчет электростатического потенциала полипептидов методом молекулярных орбиталей фрагментов
Научный руководитель:
Миронов В.А.
Автор: Брехов А.Т., (Специалист)
2014
Моделирование механизма реакции гидролиза гуанозинтрифосфата в активном центре Ras-GAP
Научный руководитель:
Миронов В.А.
Автор: Лычко Л.А., (Специалист)
Выступление в СМИ
15 марта 2022 г.
Российский суперкомпьютер ускорил разработку «цифровых лекарств» от COVID-19
(РСК)
Автор (участник):
Миронов Владимир Андреевич
27 ноября 2019 г.
SC19: исследование эффективности Intel Optane DCPMM и IMDT в научных расчётах
(ServerNews)
Авторы (участники):
Алексей Степин,
Миронов Владимир Андреевич
,
Chernykh Igor
27 июня 2016 г.
Modern Quantum Chemistry Research Possible Because of Supercomputers, HPC Software
(Scientific computing)
Автор (участник):
Linda Barney,
Миронов Владимир Андреевич