|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ИНХС РАН |
||
Создание иерархической молекулярной модели взаимодействий между белками переносчиками электрона в цианобактериях, водорослях и высших растениях.НИР
- Руководитель НИР: Коваленко И.Б.
- Участники НИР: Абатурова А.М., Воронова Е.Н., Дьяконова А.Н., Зленко Д.В., Конюхов И.В., Лукашев Е.П., Сьянова Д.П., Федоров В.А., Хрущев С.С.
- Подразделение: Кафедра биофизики
- Срок исполнения: 9 февраля 2015 г. - 31 декабря 2017 г.
- Номер договора (контракта, соглашения): 15-04-08681 А
- Номер ЦИТИС: 115020610092
- Тип: Фундаментальная
- Приоритетное направление научных исследований: Физико-химические основы биологии и биотехнологии
- ПН России: Науки о жизни
- Направление технологического прорыва России: Медицинские технологии и лекарственные средства
-
Рубрики ГРНТИ:
- 34.17.03 Теоретическая и математическая биофизика
-
Ключевые слова:
броуновская динамика, взаимодействие белков, квантовая химия, субклеточная система, гидрофобные взаимодействия, электростатические взаимодействия, молекулярное моделирование
-
Описание:
Проект посвящен изучению механизмов белок-белковых взаимодействий электронно-транспортных белков. Будет создана иерархическая компьютерная молекулярная модель белок-белковых взаимодействий, позволяющая описать наблюдаемые в реальных условиях редокс-превращения в реакциях переноса электрона пластоцианином с цитохромного bf комплекса на фотосистему 1 в цианобактериях, зеленых водорослях и высших растениях. В основе предлагаемого подхода лежит интеграция методов молекулярной динамики и броуновской динамики в рамках единой многоуровневой модели, позволяющей осуществлять комбинированное моделирование сложных биологических процессов, протекающих в клетке, с разной степенью детализации во времени и пространстве. Будет проведена регистрация кинетики изменения окислительно-восстановительного состояния цитохрома f, пластоцианина и фотосистемы 1 на изолированных хлоропластах высших растений, зеленых водорослях Chlamydomonas и цианобактериях Synechocystis и Nostoc для верификации модели. Результаты проекта позволят выявить молекулярные механизмы взаимодействия белков фотосинтетической электрон-транспортной цепи и роль физико-химических факторов (диффузии, электростатических и гидрофобных взаимодействий и конформационной подвижности) в процессах электронного транспорта.
- Добавил в систему: Коваленко Илья Борисович
Источник финансирования НИР
| грант РФФИ |
Этапы НИР
| # | Сроки | Название |
| 1 | 1 января 2015 г.-31 декабря 2015 г. | Создание иерархической молекулярной модели взаимодействий между белками переносчиками электрона в цианобактериях, водорослях и высших растениях. |
| Результаты этапа: Проект посвящен изучению механизмов белок-белковых взаимодействий электронно-транспортных белков. Будет создана иерархическая компьютерная молекулярная модель белок-белковых взаимодействий, позволяющая описать наблюдаемые в реальных условиях редокс-превращения в реакциях переноса электрона пластоцианином с цитохромного bf комплекса на фотосистему 1 в цианобактериях, зеленых водорослях и высших растениях. В основе предлагаемого подхода лежит интеграция методов молекулярной динамики и броуновской динамики в рамках единой многоуровневой модели, позволяющей осуществлять комбинированное моделирование сложных биологических процессов, протекающих в клетке, с разной степенью детализации во времени и пространстве. Будет проведена регистрация кинетики изменения окислительно-восстановительного состояния цитохрома f, пластоцианина и фотосистемы 1 на изолированных хлоропластах высших растений, зеленых водорослях Chlamydomonas и цианобактериях Synechocystis и Nostoc для верификации модели. Результаты проекта позволят выявить молекулярные механизмы взаимодействия белков фотосинтетической электрон-транспортной цепи и роль физико-химических факторов (диффузии, электростатических и гидрофобных взаимодействий и конформационной подвижности) в процессах электронного транспорта. | ||
| 2 | 1 января 2016 г.-31 декабря 2016 г. | Создание иерархической молекулярной модели взаимодействий между белками переносчиками электрона в цианобактериях, водорослях и высших растениях. |
| Результаты этапа: | ||
| 3 | 1 января 2017 г.-31 декабря 2017 г. | Создание иерархической молекулярной модели взаимодействий между белками переносчиками электрона в цианобактериях, водорослях и высших растениях. |
| Результаты этапа: | ||
Прикрепленные к НИР результаты
Для прикрепления результата сначала выберете тип результата (статьи, книги, ...). После чего введите несколько символов в поле поиска прикрепляемого результата, затем выберете один из предложенных и нажмите кнопку "Добавить".