|
ИСТИНА |
Войти в систему Регистрация |
ИСТИНА ИНХС РАН |
||
Изучение конформационной подвижности липид-связывающего сайта изоформ ε2, ε3, ε4 аполипопротеина E методом молекулярной динамикистатья Исследовательская статья
Статья опубликована в журнале из списка RSCI Web of Science
Статья опубликована в журнале из перечня ВАК- Авторы: Мамчур А.А., Ерема В.В., Каштанова Д.А., Иванов М.В., Юдин В.С., Кескинов А.А., Краевой С.А., Юдин С.М.
- Журнал: Вестник Московского университета. Серия 16: Биология
- Том: 78
- Номер: №2
- Год издания: 2023
- Издательство: Изд-во Моск. ун-та
- Местоположение издательства: М.
- Первая страница: 70
- Последняя страница: 77
- DOI: 10.55959/msu0137-0952-16-78-2-3
- Аннотация: Нейродегенеративные заболевания, в особенности болезнь Альцгеймера, являются одной из наиболее острых проблем человечества. Несмотря на растущее число исследований в данной области, молекулярные механизмы развития данных заболеваний до сих пор неизвестны. Полиморфизмы в гене APOE, кодирующем аполипопротеин Е, достоверно ассоциированы как с развитием нейродегенеративных состояний (rs429358, C112R), так и с механизмами защиты от них (rs7412, R158C). В популяции человека присутствует три изоформы аполипопротеина E – ε2 (белок с «защитной» заменой), ε3 (белок дикого типа), ε4 (белок с «патогенной» заменой). Данная работа посвящена изучению влияния описанных замен на функциональный участок белка – липид-связывающий сайт – методом молекулярной динамики. В исследовании одновременно рассмотрены все три изоформы аполипопротеина E. Показано, что как «патогенная», так и «защитная» аминокислотные замены приводят к изменению структуры липид-связывающего сайта по сравнению со структурой дикого типа, но суть этих изменений различна. Расстояние между N-концевой (аминокислоты 88-104) и C-концевой (аминокислоты 251-266) α-спиралями липид-связывающего сайта увеличивается в обеих изоформах. Однако для изоформы ε2 характерно сохранение структуры С-концевой α-спирали, в то время как для изоформы ε4 наблюдается расплетание участка из аминокислот 260-266. Для N-концевой α-спирали наблюдается обратная ситуация. Можно предположить, что именно такие структурные различия в липид-связывающем сайте АпоE лежат в основе разного влияния описанных изоформ на клинические показатели носителей соответствующих генотипов. Кластерный анализ позволил выделить структуры, наиболее характерные для изоформ ε2 и ε4, которые будут в дальнейшем использованы как стартовые конформации для последующих молекулярно-динамических исследований.
- Добавил в систему: Мамчур Александра Александровна