Области научных интересов
Проводятся исследования морфологии вирионов, структуры и функции белков оболочечных вирусов, включая вирусы гриппа А, В, С; SARS-CoV-2, а также потенциальные и зарегистрированные вакцинные препараты
Ключевые слова: вирус гриппа; гемагглютинин; белок М1; SARS-CoV-2; S-белок; S-ацилирование; вакцинные препараты / influenza virus; hemagglutinin; М1 protein; SARS-CoV-2; S-protein; S-acylation; vaccines
Статьи в журналах
-
- 2023 Криоэлектронная микроскопия оболочечных вирусов на базе усовершенствованного просвечивающего электронного микроскопа: вирусы гриппа типа А, В и коронавирус SARS-CoV-2
- Кордюкова Л.В., Моисеенко А.В., Тимофеева Т.А., Федякина И.Т.
- в журнале Вестник Московского университета. Серия 16: Биология, издательство Изд-во Моск. ун-та (М.), том 78, № 3S, с. 21-26 DOI
-
- 2023 Peptide Models of the Cytoplasmic Tail of Influenza A/H1N1 Virus Hemagglutinin Expand Understanding its pH-Dependent Modes of Interaction with Matrix Protein M1
- Poboinev Victor Vitoldovich, Khrustalev Vladislav Victorovich, Akunevich Anastasia Aleksandrovna, Shalygo Nikolai Vladimirovich, Stojarov Aleksander Nikolaevich, Khrustaleva Tatyana Aleksandrovna, Kordyukova Larisa Valentinovna
- в журнале Protein Journal, издательство Springer Verlag (Germany), с. 1-17 DOI
-
- 2023 Structural and Immunoreactivity Properties of the SARS-CoV-2 Spike Protein upon the Development of an Inactivated Vaccine
- Kordyukova Larisa V., Moiseenko Andrey V., Serebryakova Marina V., Shuklina Marina A., Sergeeva Maria V., Lioznov Dmitry A., Shanko Andrei V.
- в журнале Viruses, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 15, № 2, с. 480 DOI
-
- 2022 The mechanism of selective recognition of lipid substrate by hDHHC20 enzyme
- Panina Irina S., Krylov Nikolay A., Chugunov Anton O., Efremov Roman G., Kordyukova Larisa V.
- в журнале International Journal of Molecular Sciences, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 23, № 23, с. 14791 DOI
-
- 2022 Molecular Dynamics of DHHC20 Acyltransferase Suggests Principles of Lipid and Protein Substrate Selectivity
- Panina Irina, Krylov Nikolay, Gadalla Mohamed Rasheed, Aliper Elena, Kordyukova Larisa, Veit Michael, Chugunov Anton, Efremov Roman
- в журнале International Journal of Molecular Sciences, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 23, № 9, с. 5091 DOI
-
- 2022 The cytoplasmic tail of Influenza A/H1N1 virus hemagglutinin is β-structural
- Khrustalev V.V., Kordyukova L.V., Arutyunyan A.M., Poboinev V.V., Khrustaleva T.A., Stojarov A.N., Baratova L.A., Sapon A.S., Lugin V.G.
- в журнале Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, издательство Adenine Press (United States), том 40, № 10, с. 4642-4661 DOI
-
- 2021 Differential Fatty Acylation Of Influenza A Virus Hemagglutinin Is Sensitive To Mutations In The Cholesterol Consensus Motive
- Kordyukova Larisa V., Hu Bodan, Serebryakova Marina V., Veit Michael
- в журнале Protein Science, издательство Cold Spring Harbor Laboratory Press (United States), том 30, № S1, с. 176-177 DOI
-
- 2021 The cytoplasmic tail of Influenza A virus hemagglutinin and membrane lipid composition change the mode of M1 protein association with the lipid bilayer
- Kordyukova Larisa V., Konarev Petr V., Fedorova Nataliya V., Shtykova Eleonora V., Ksenofontov Aleksander L., Loshkarev Nikita A., Dadinova Lubov A., Timofeeva Tatyana A., Abramchuk Sergei S., Moiseenko Andrei V., Baratova Lyudmila A., Svergun Dmitri I., Batishchev Oleg V.
- в журнале Membranes, издательство MDPI Publishing (Basel, Switzerland, Switzerland), том 11, № 10 DOI
-
- 2021 Stearic acid blunts growth-factor signaling via oleoylation of GNAI proteins
- Nůsková Hana, Serebryakova Marina V., Ferrer-Caelles Anna, Sachsenheimer Timo, Lüchtenborg Christian, Miller Aubry K., Brügger Britta, Kordyukova Larisa V., Teleman Aurelio A.
- в журнале Nature communications, издательство Nature Pub. Group (United Kingdom), том 12, № 1 DOI
-
- 2021 COVID-19: Myths and Reality
- Kordyukova L.V., Shanko A.V.
- в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 86, № 7, с. 800-817 DOI
-
- 2021 COVID-19: Мифы и реальность
- Кордюкова Л.В., Шанько А.В.
- в журнале Биохимия, издательство ФГБУ "Издательство "Наука" (Москва), том 86, № 7, с. 964-984 DOI
-
- 2021 NS1-mediated upregulation of ZDHHC22 acyltransferase in Influenza A virus infected cells
- Gadalla M.R., Morrison E., Serebryakova M.V., Han X., Wolff T., Freund C., Kordyukova L.V., Veit M.
- в журнале Cellular Microbiology, издательство Blackwell Publishing Inc. (United Kingdom) DOI
-
- 2021 Структура вирионов A-вируса картофеля по данным малоуглового рентгеновского рассеяния и комплементарных методов
- Штыкова Э.В., Петухов М.В., Федорова Н.В., Арутюнян А.М., Скурат Е.В., Кордюкова Л.В., Моисеенко А.В., Ксенофонтов А.Л.
- в журнале Биохимия, издательство ФГБУ "Издательство "Наука" (Москва), том 86, № 2, с. 274-287 DOI
-
- 2020 Comparative Immunological Study in Mice of Inactivated Influenza Vaccines Used in the Russian Immunization Program
- Shanko Andrei, Shuklina Marina, Kovaleva Anna, Zabrodskaya Yana, Vidyaeva Inna, Shaldzhyan Aram, Fadeev Artem, Korotkov Alexander, Zaitceva Marina, Stepanova Liudmila, Tsybalova Liudmila, Kordyukova Larisa, Katlinski Anton
- в журнале VACCINES, том 8, № 4, с. 756 DOI
-
- 2020 Characterization of Inactivated Influenza Vaccines Used in the Russian National Immunization Program
- Tarasov Mikhail, Shanko Andrei, Kordyukova Larisa, Katlinski Anton
- в журнале VACCINES, том 8, № 3, с. 488 DOI
-
- 2020 Filamentous versus Spherical Morphology: A CaseStudy of the Recombinant A/WSN/33 (H1N1) Virus
- Kordyukova Larisa V., Mintaev Ramil R., Rtishchev Artyom A., Kunda Marina S., Ryzhova Natalia N., Abramchuk Sergei S., Serebryakova Marina V., Khrustalev Vladislav V., Khrustaleva Tatyana A., Poboinev Victor V., Markushin Stanislav G., Voronina Olga L.
- в журнале Microscopy and Microanalysis, издательство Cambridge University Press (United Kingdom), том 26, № 2, с. 297-309 DOI
-
- 2019 СТРУКТУРНЫЕ ИССЛЕДОВАНИЯ ЛИПИДНЫХ МОДИФИКАЦИЙ ВИРУСНЫХ И КЛЕТОЧНЫХ БЕЛКОВ
- Кордюкова Л.В., Серебрякова М.В., Файт М., Нускова Х., Телеман А.A.
- в журнале Acta Naturae (русскоязычная версия), издательство Парк-медиа (М.), том 2, с. 43-43
-
- 2019 Structural study of Influenza virus hemagglutinin C-terminal region
- Khrustalev V.V., Khrustaleva T.A., Arutyunyan A.M., Shtykova E.V., Petoukhov M.V., Fedorova N.V., Poboinev V.V., Kordyukova L.V.
- в журнале FEBS open bio, издательство John Wiley & Sons Inc. (United States), том 9, № Suppl. 1, с. 253-253 DOI
-
- 2019 S-Acylation of Proteins
- Kordyukova Larisa, Krabben Ludwig, Serebryakova Marina, Veit Michael
- в журнале Methods in molecular biology (Clifton, N.J.), издательство Humana Press, Inc. (United States), том 1934, с. 265-291 DOI
-
- 2019 Differential S-acylation of Enveloped Viruses
- Kordyukova L.V., Serebryakova M.V., Khrustalev V.V., Veit M.
- в журнале Protein and Peptide Letters, издательство Bentham Science Publishers (Netherlands), том 26, № 8, с. 588-600 DOI
-
- 2019 Matrix proteins protein of enveloped viruses: a case study of Influenza A virus M1
- Kordyukova Larisa V., Shtykova Eleonora V., Baratova Lyudmila A., Svergun Dmitri I., Batishchev Oleg V.
- в журнале Journal of Biomolecular Structure and Dynamics, издательство Adenine Press (United States), том 37, № 3, с. 671-690 DOI
-
- 2018 Общность строения подмембранного участка различных подтипов гемагглютинина вируса гриппа А
- Хрусталев В.В., Кордюкова Л.В., Хрусталева Т.А., Побойнев В.В.
- в журнале Новости медико-биологических наук, том 18, № 1, с. 115-116
-
- 2018 The role and potential benefits of structural disorder in viral replication machinery: structural study of Influenza A virus M1 protein
- Shtykova E., Kordyukova L., Batishchev O.
- в журнале FEBS open bio, издательство John Wiley & Sons Inc. (United States), том 8, с. 437-437 DOI
-
- 2017 Lipidation of viral proteins studied with MALDI-TOF MS
- Larisa Kordyukova, Marina Serebryakova, Michael Veit
- в журнале Journal of integrated OMICS, издательство Proteomass ([S.l.],), том 7, № 1, с. 34 DOI
-
- 2017 Structural and functional specificity of Influenza virus haemagglutinin and paramyxovirus fusion protein anchoring peptides
- Kordyukova L.
- в журнале Virus Research, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 227, с. 183-199 DOI
-
- 2016 Acylation of influenza virus membrane proteins: biochemistry and function
- Brett K., Siche S., Wang M.Y., Thaa B., Herrmann A., Kordyukova L., Veit M.
- в журнале Amino Acids, издательство Springer Verlag (Germany), том 48, № 2, с. 618-618 DOI
-
- 2015 Two Cytoplasmic Acylation Sites and an Adjacent Hydrophobic Residue, but No Other Conserved Amino Acids in the Cytoplasmic Tail of HA from Influenza A Virus Are Crucial for Virus Replication
- Siche S., Brett K., Möller L., Kordyukova L.V., Mintaev R.R., Alexeevsky A.V., Veit M.
- в журнале Viruses, издательство MDPI (Basel, Switzerland), том 7, № 12, с. 6458-6475 DOI
-
- 2014 Site Specific S-acylation of Influenza Virus Hemagglutinin: the Location of the Acylation Site Relative to the Membrane Border is the Decisive Factor for Attachment of Stearate
- Katharina Brett, Kordyukova Larisa V., Serebryakova Marina V., Mintaev Ramil R., Alexeevski Andrei V., Michael Veit
- в журнале Journal of Biological Chemistry, издательство American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc. (United States) DOI
-
- 2014 Co-evolution analysis to predict protein-protein interactions within Influenza virus envelope
- Mintaev R.R., Alexeevski A.V., Kordyukova L.V.
- в журнале Journal of Bioinformatics and Computational Biology, издательство Imperial College Press (United Kingdom), том 12, № 2 DOI
-
- 2013 Structural investigation of influenza virus hemagglutinin membrane-anchoring peptide
- Mineev Konstantin S., Lyukmanova Ekaterina N., Krabben Ludwig, Serebryakova Marina V., Shulepko Mikhail A., Arseniev Alexander S., Kordyukova Larisa V., Veit Michael
- в журнале Protein Engineering, Design and Selection, издательство Oxford University Press (United Kingdom), том 26, № 9, с. 547-552 DOI
-
- 2013 Palmitoylation of influenza virus proteins
- Veit Michael, Serebryakova Marina V., Kordyukova Larisa V.
- в журнале Biochemical Society Transactions, издательство Portland Press, Ltd. (United Kingdom), том 41, № 1, с. 50-55 DOI
-
- 2013 Mass spectrometry analysis of influenza virus reassortant clones does not reveal an influence of other viral proteins on S-acylation of hemagglutinin
- Serebryakova MV, Kordyukova LV, Rudneva IA, Kropotkina EA, Veit M., Baratova LA
- в журнале Archives of Virology, издательство Springer Verlag (Germany), том 158, № 2, с. 467-472 DOI
-
- 2012 Масс-спектрометрические подходы в изучении оболочечных вирусов: новые возможности для структурной биологии и профилактической медицины
- Кордюкова Л.В., Серебрякова М.В.
- в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 77, № 8, с. 1002-1016
-
- 2012 Mass spectrometric approaches to study enveloped viruses: New possibilities for structural biology and prophylactic medicine
- Kordyukova L.V., Serebryakova M.V.
- в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 77, № 8, с. 830-842 DOI
-
- 2011 Influenza virus hemagglutinin spike neck architectures and interaction with model enzymes evaluated by MALDI-TOF mass spectrometry and bioinformatics tools
- Serebryakova M.V., Kordyukova L.V., Semashko T.A., Ksenofontov A.L., Rudneva I.A., Kropotkina E.A., Filippova I.Y., Veit M., Baratova L.A.
- в журнале Virus Research, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 160, № 1-2, с. 294-304 DOI
-
- 2011 Linker and/or transmembrane regions of influenza A/Group-1, A/Group-2, and type B virus hemagglutinins are packed differently within trimers
- Kordyukova L.V., Serebryakova M.V., Polyansky A.A., Kropotkina E.A., Alexeevski A.V., Veit M., Efremov R.G., Filippova I.Y., Baratova L.A.
- в журнале Biochimica et Biophysica Acta - Biomembranes, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 1808, № 7, с. 1843-1854 DOI
-
- 2010 Site-specific attachment of palmitate or stearate to cytoplasmic versus transmembrane cysteines is a common feature of viral spike proteins
- Kordyukova Larisa V., Serebryakova Marina V., Baratova Ludmila A., Veit Michael
- в журнале Virology, издательство Academic Press (United States), том 398, № 1, с. 49-56 DOI
-
- 2009 The In Situ Structural Characterization of the Influenza A Virus Matrix M1 Protein within a Virion
- Shishkov Alexander V., Bogacheva Elena N., Dolgov Alexey A., Chulichkov Alexey L., Knyazev Denis G., Fedorova Natalia V., Ksenofontov Alexander L., Kordyukova Larisa V., Lukashina Elena V., Mirsky Vladimir M., Baratova Lyudmila A.
- в журнале Protein and Peptide Letters, издательство Bentham Science Publishers (Netherlands), том 16, № 11, с. 1407-1413 DOI
-
- 2008 Вирион вируса гриппа как субстрат протеолитических ферментов
- Смирнова Ю.А., Кордюкова Л.В., Серебрякова М.В., Филиппова И.Ю., Лысогорская Е.Н., Баратова Л.А.
- в журнале Биоорганическая химия, издательство Российская академия наук (Москва), том 34, № 3, с. 409-415
-
- 2008 Flu virion as a substrate for proteolytic enzymes
- Smirnova Yu A., Kordyukova L.V., Serebryakova M.V., Filippova I.Yu, Lysogorskaya E.N., Baratova L.A.
- в журнале Russian Journal of Bioorganic Chemistry, издательство Maik Nauka/Interperiodica Publishing (Russian Federation), том 34, № 3, с. 369-374 DOI
-
- 2008 S acylation of the hemagglutinin of influenza viruses: Mass spectrometry reveals site-specific attachment of stearic acid to a transmembrane cysteine
- Kordyukova Larisa V., Serebryakova Marina V., Ludmila A Baratova, Veit Michael
- в журнале Journal of Virology, издательство American Society for Microbiology (United States), том 82, № 18, с. 9288-9292 DOI
-
- 2008 Influenza A virus M1 protein structure probed by in situ limited proteolysis with bromelain
- Kordyukova L.V., Serebryakova M.V., Polyakov V.Y., Ovchinnikova T.V., Smirnova Yu A., Fedorova N.V., Baratova L.A.
- в журнале Protein and Peptide Letters, издательство Bentham Science Publishers (Netherlands), том 15, № 9, с. 922-930 DOI
-
- 2008 Quantitation of the Glycoprotein Spike Area on the Surface of Enveloped Viruses
- Ksenofontov A.L., Badun G.A., Fedorova N.V., Kordyukova L.V.
- в журнале Molecular Biology, издательство Maik Nauka/Interperiodica Publishing (Russian Federation), том 42, № 6, с. 973-975 DOI
-
- 2007 Isolation of the influenza a HA2 C-terminal segment by combination of nonionic detergents
- Smirnova Y.A., Fedorova N.V., Serebryakova M.V., Kordyukova L.V., Ksenofontov A.L., Radyukhin V.A., Vaskovsky B.V., Baratova A.
- в журнале Biopolymers, издательство John Wiley & Sons Inc. (United States), том 88, № 4, с. 589-589
-
- 2006 Mass spectrometric sequencing and acylation character analysis of the C-terminal anchoring segment from Influenza A hemagglutinin
- Serebryakova M.V., Kordyukova L.V., Baratova L.A., Markushin S.G.
- в журнале European Journal of Mass Spectrometry, издательство IM Publications (United Kingdom), том 12, № 1, с. 51-62 DOI
-
- 2006 Influenza a virus particles as a substrate for bromelain
- Kordyukova L.V., Serebryakova M.V., Smirnova Y.A., Ovchinnikova T.V., Lysogorskaya E.N., Filippova I.Y., Baratova L.A.
- в журнале Journal of Peptide Science, издательство John Wiley & Sons Inc. (United States), том 12, с. 168-168
-
- 2006 [The properties of the epidemic influenza viruses A and B strains circulating in Russia in the 2004-2005 epidemic season]
- Ivanova V.T., Rakutina R.O., Slepushkin A.N., Burtseva E.I., Oskerko T.A., Shevchenko E.S., Fedorova N.V., Kordiukova L.V., Trushakova S.V., Cherkasov E.G., Merkulova L.N., Feodoritova E.L.
- в журнале Voprosy Virusologii, издательство Meditsina Publishers (Russian Federation), том 51, № 6, с. 27-30
-
- 2006 Determination of concentration and aggregate size in influenza virus preparations from the true UV-absorption spectra
- Ksenofontov A.L., Kozlovsky V.S., Kordyukova L.V., Radyukhin V.A., Timofeeva A.V., Dobrov E.N.
- в журнале Molecular Biology, издательство Maik Nauka/Interperiodica Publishing (Russian Federation), том 40, № 1, с. 172-179 DOI
-
- 2006 [Internal epidemic influenza virus proteins: isolation and investigation]
- Ivanova V.T., Rakutina R.O., Kordiukova L.V., Manykin A.A., Fedorova N.V., Ksenofontov A.L., Slepushkin A.N.
- в журнале Voprosy Virusologii, издательство Meditsina Publishers (Russian Federation), том 51, № 2, с. 22-6
-
- 2005 Thioester bond liability: Study on natural influenza and model acylpeptides
- Serebryakova M.V., Kordyukova L.V., Vaskovsky B.V., Baratova L.A.
- в журнале Biopolymers, издательство John Wiley & Sons Inc. (United States), том 80, № 4, с. 545-546
-
- 2004 INFLUENZA A HEMAGGLUTININ C-TERMINAL ANCHORING PEPTIDE: IDENTIFICATION AND MASS SPECTROMETRIC STUDY
- Kordyukova L.V., Ksenofontov A.L., Fedorova N.V., Baratova L.A., Serebryakova M.V., Ovchinnikova T.V., Ivanova V.T.
- в журнале Protein and Peptide Letters, издательство Bentham Science Publishers (Netherlands), том 11, с. 385-391 DOI
-
- 2004 Influenza A hemagglutinin C-terminal anchoring peptide: identification and mass spectrometric study
- Kordyukova LV, Ksenofontov AL, Serebryakova MV, Ovchinnikova TV, Fedorova NV
- в журнале Protein and Peptide Letters, издательство Bentham Science Publishers (Netherlands), том 11, № 4, с. 385-391 DOI
-
- 2004 INFLUENZA A HEMAGGLUTININ C-TERMINAL ANCHORING PEPTIDE. MS IDENTIFICATION AND APPROACH TO STRUCTURAL STUDY
- Kordyukova L.V., Ksenofontov A.L., Serebryakova M.V., Ovchinnikova T.V., Fedorova N.V., Ivanova V.T., Baratova L.A.
- в журнале Journal of Peptide Science, издательство John Wiley & Sons Inc. (United States), том 10, с. 165-165
-
- 2003 [The use of bromelain in obtaining the subviral particles of influenza A and B viruses]
- Ivanova V.T., Kordiukova L.V., Manykin A.A., Burtseva E.I., Zagorskaia Iu V., Oskerko T.A., Slepushkin A.N.
- в журнале Voprosy Virusologii, издательство Meditsina Publishers (Russian Federation), том 48, № 5, с. 14-8
-
- 2002 Studying the spatial organization of membrane proteins by means of tritium stratigraphy: bacteriorhodopsin in purple membrane
- Shishkov A.V., Ksenofontov A.L., Bogacheva E.N., Kordyukova L.V., Badun G.A., Alekseevsky A.V., Tsetlin V.I., Baratova L.A.
- в журнале Bioelectrochemistry, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 56, № 1-2, с. 147-149 DOI
Статьи в сборниках
-
- 2007 A virus particles as a substrate for bromelain: revealing of the matrix M1 protein accessibility for limited proteolysis
- Kordyukova L.V., Serebryakova M.V., Smirnova Y.A., Ovchinnikova T.V., Lysogorskaya E.N., Filippova I.Yu
- в сборнике Peptides, серия Proc. оf the 29th European Peptide Symposium, место издания Kenes International Tel-Aviv. Israel, с. Paper 0111 -Paper 0111
-
- 2005 Thioester Bond Liability: Study on Natural Influenza and Model Acylpeptides
- Serebryakova M.V., Kordyukova L.V., Vaskovsky B.V., Baratova L.A.
- в сборнике Proceedings of the 19th American Peptide Symposium «Understanding Biology Using Peptides", место издания USA. Ed.: Sylvie E. Blondelle, с. 307-308
-
- 2004 Influenza A hemagglutinin C-terminal anchoring peptide. MS identification and approach to structural study
- Kordyukova L.V., Serebryakova M.V., Ovchinnikova T.V., Ivanova V.T., Baratova L.A.
- в сборнике Peptides-2004, серия Proceedings of the 3rd International and 28th European Peptide Symposium. Prague (Czech Rep.), место издания Kenes International Tel-Aviv. Israel. Eds.: M. Flegel, M. Fridkin, C. Gilon, J. Slaninova, с. 435-436
Ключевые слова
Вирус гриппа, липосомы, пост-трансляционные модификации белков, S-ацилирование, белок-липидные взаимодействия, масс-спектрометрия
Influenza virus, liposomes, post-translational modifications of proteins, S-acylation, protein-lipid interactions, mass spectrometry