ИСТИНА

Чудаков Дмитрий Михайлович пользователь

Соавторы: Лебедев Ю.Б., Mamedov I.Z., Komech E.A., Pogorelyy M.V., Звягин И., Minervina A.A., Лукьянов С.А., Shugay M., Ефимов Г.А., Масчан М.А., Britanova O.V., Komkov A.Y., Mora T. показать полностью..., Olshanskaya Y., Sycheva A., Walczak A., Круглов А.А., Недоспасов С.А., Chashchina A.A., Izraelson M., Kasatskaya S., Miroshnichenkova A., Pogorelyy M., Staroverov D.B., Брюшкова Е.А., Друцкая М.С., Мусаткина Е.Н., Тиллиб С.В., Balunets D.V., Bensouda K.M., Bolotin D.A., Brilliantova V., Elhanati Y., Franzke A., Kedzierska K., Lukyanov K.A., Marcou Q., Maschan A., Merzliak E., Nakonechnaya T.O., Rosati E., Rowntree L.C., Serebrovskaya E.O., Serebrovskaya O.E., Shelyakin P.V., Turchaninova M.A., Turchaninova M., Yuzhakova D., Zaretsky A.R., Брутер А.В., Давыдов А.Н., Дюгай И.А., Егоров Е., Зварцев Р.В., Зорникова К.В., Казанский Д.Б., Калинина А.А., Карабут М.М., Кошенкова А.В., Кучмий А.А., Лукьянов Д.А., Матвеев В.Б., Мудрик Е.С., Назаров В.И., Нестеренко Л.Н., Путинцева Е.В., Ребриков Д.В., Самойленко И.В., Сырко Д.С., Феофанов А.В., Халмурзаев О.А., Хромых Л.М., Шебзухов Ю.В., Шитиков С.А.

18 статей, 3 доклада на конференциях, 2 тезисов докладов, 1 дипломная работа

Количество цитирований статей в журналах по данным Web of Science: 345, Scopus: 364

IstinaResearcherID (IRID): 2672984

Деятельность

• Статьи в журналах

  • • 2023 The use of non-functional clonotypes as a natural calibrator for quantitative bias correction in adaptive immune receptor repertoire profiling
    • Smirnova A.O., Miroshnichenkova A.M., Olshanskaya Y.V., Maschan M.A., Lebedev Y.B., Chudakov D.M., Mamedov I.Z., Komkov A.
    • в журнале eLife, том 12, с. 12-10 DOI
  • 
    • 2022 Accounting for B-cell behavior and sampling bias predicts anti-PD-L1 response in bladder cancer
    • Dyugay Ilya A., Lukyanov Daniil K., Turchaninova Maria A., Serebrovskaya Ekaterina O., Bryushkova Ekaterina A., Zaretsky Andrew R., Khalmurzaev Oybek, Matveev Vsevolod Borisovich, Shugay Mikhail, Shelyakin Pavel V., Chudakov Dmitriy M.
    • в журнале Cancer Immunology Research, том 10, № 3, с. 343-353 DOI
  • • 2022 VDJdb in the pandemic era: a compendium of T cell receptors specific for SARS-CoV-2
    • Goncharov Mikhail, Bagaev Dmitry, Shcherbinin Dmitrii, Zvyagin Ivan, Bolotin Dmitry, Thomas Paul G., Minervina Anastasia A., Pogorelyy Mikhail V., Ladell Kristin, McLaren James E., Price David A., Nguyen Thi H.O., Rowntree Louise C., Clemens E.Bridie, Kedzierska Katherine, Dolton Garry, Rius Cristina Rafael, Sewell Andrew, Samir Jerome, Luciani Fabio, Zornikova Ksenia V., Khmelevskaya Alexandra A., Sheetikov Saveliy A., Efimov Grigory A., Chudakov Dmitry, Shugay Mikhail
    • в журнале Nature Methods, издательство Nature Publishing Group (United Kingdom), том 19, № 9, с. 1017-1019 DOI
  • 
    • 2021 Longitudinal high-throughput TCR repertoire profiling reveals the dynamics of T-cell memory formation after mild COVID-19 infection
    • Minervina AA, Komech EA, Titov A., Bensouda Koraichi M., Rosati E., Mamedov IZ, Franke A., Efimov GA, Chudakov DM, Mora T., Walczak AM, Lebedev YB, Pogorelyy MV
    • в журнале eLife, том 10 DOI
  • 
    • 2020 Adoptive Immunotherapy Based on Chain-Centric TCRs in Treatment of Infectious Diseases
    • Kalinina Anastasiia A., Nesterenko Ludmila N., Bruter Alexandra V., Balunets Denis V., Chudakov Dmitriy M., Izraelson Mark, Britanova Olga V., Khromykh Ludmila M., Kazansky Dmitry B.
    • в журнале iScience, издательство Cell Press (United States), том 23, № 12 DOI
  • 
    • 2020 Measuring Intratumoral Heterogeneity of Immune Repertoires
    • Yuzhakova D.V., Volchkova L.N., Pogorelyy M.V., Serebrovskaya O.E., Shagina I.A., Bryushkova E.A., Nakonechnaya T.O., Izosimova A.V., Zavyalova D.S., Karabut M.M., Izraelson M., Samoylenko I.V., Zagainov V.E., Chudakov D.M., Zagaynova E.V., Sharonov G.V.
    • в журнале Frontiers in oncology, издательство Frontiers Research Foundation (Switzerland), том 10, с. 1-13 DOI
  • 
    • 2018 A STUDY OF THE REPERTOIRE OF ACTIVATED T-CELL CLONES OBTAINED FROM A PATIENT WITH ANKYLOSING SPONDYLITIS
    • Komech E.A., Lebedev Y.B., Koshenkova A.V., Syrko D.S., Musatkina E.A., Lukyanov S.A., Chudakov D.M., Zvyagin I.V.
    • в журнале Bulletin of RSMU, издательство Pirogov Russian National Research Medical University (Moscow), № 1, с. 60-67 DOI
  • 
    • 2018 Method for identification of condition-associated public antigen receptor sequences
    • Pogorelyy MV, Minervina AA, Chudakov DM, Mamedov IZ, Lebedev YB, Mora T., Walczak AM
    • в журнале eLife, том 7, с. pii: e33050 DOI
  • 
    • 2018 Quantitative profiling reveals minor changes of T cell receptor repertoire in response to subunit inactivated influenza vaccine
    • Sycheva AL, Pogorelyy MV, Komech EA, Minervina AA, Zvyagin IV, Staroverov DB, Chudakov DM, Lebedev YB, Mamedov IZ
    • в журнале Vaccine, издательство Elsevier BV (Netherlands), том 36, № 12, с. 1599-1605 DOI
  • • 2018 ИССЛЕДОВАНИЕ КЛОНАЛЬНОГО РЕПЕРТУАРА ФРАКЦИИ АКТИВИРОВАННЫХ Т-ЛИМФОЦИТОВ У ПАЦИЕНТА С АНКИЛОЗИРУЮЩИМ СПОНДИЛИТОМ
    • Комеч Е.А., Лебедев Ю.Б., Кошенкова А.В., Сырко Д.С., Мусаткина Е.А., Лукьянов С.А., Чудаков Д.М., Звягин И.В.
    • в журнале Вестник Российского государственного медицинского университета, издательство РНИМУ им. Н. И. Пирогова (Москва), № 1, с. 65-73 DOI
  • 
    • 2017 Persisting fetal clonotypes influence the structure and overlap of adult human T cell receptor repertoires
    • Pogorelyy MV, Elhanati Y., Marcou Q., Sycheva AL, Komech EA, Nazarov VI, Britanova OV, Chudakov DM, Mamedov IZ, Lebedev YB, Mora T., Walczak AM
    • в журнале PLoS Computational Biology, издательство Public Library of Science (United States), том 13, № 7, с. e1005572 DOI
  • 
    • 2017 Tracking T-cell immune reconstitution after TCR alpha beta/CD19-depleted hematopoietic cells transplantation in children
    • Zvyagin I.V., Mamedov IZ, Tatarinova OV, Komech EA, Kurnikova EE, Boyakova EV, Brilliantova V., Shelikhova LN, Balashov DN, Shugay M., Sycheva AL, Kasatskaya SA, Lebedev YB, Maschan AA, Maschan MA, Chudakov DM
    • в журнале Leukemia, издательство Nature Publishing Group (United Kingdom), том 31, № 5, с. 1145-1153 DOI
  • 
    • 2016 Dynamics of Individual T Cell Repertoires: From Cord Blood to Centenarians
    • Britanova OV, Shugay M., Merzlyak EM, Staroverov DB, Putintseva EV, Turchaninova MA, Mamedov IZ, Pogorelyy MV, Bolotin DA, Izraelson M., Davydov AN, Egorov ES, Kasatskaya SA, Rebrikov DV, Lukyanov S., Chudakov DM
    • в журнале Journal of Immunology, издательство American Association of Immunologists (United States), том 196, № 12, с. 5005-5013 DOI
  • 
    • 2016 Reliability of immune receptor rearrangements as genetic markers for minimal residual disease monitoring
    • Nazarov V.I., Minervina A.A., Komkov A.Y., Pogorelyy M.V., Maschan M.A., Olshanskaya Y.V., Zvyagin I.V., Chudakov D.M., Lebedev Y.B., Mamedov I.Z.
    • в журнале Bone Marrow Transplantation, издательство Nature Publishing Group (United Kingdom), том 51, № 10, с. 1408-1410 DOI
  • 
    • 2014 Experimental models of arthritis in which pathogenesis is dependent on TNF expression
    • Drutskaya M.S., Efimov G.A., Zvartsev R.V., Chashchina A.A., Chudakov D.M., Tillib S.V., Kruglov A.A., Nedospasov S.A.
    • в журнале Biochemistry (Moscow), издательство Pleiades Publishing, Ltd (Road Town, United Kingdom), том 79, № 12, с. 1650-1658
  • • 2014 ЭКСПЕРИМЕНТАЛЬНЫЕ МОДЕЛИ АРТРИТА, ПАТОГЕНЕЗ КОТОРЫХ СВЯЗАН С ЭКСПРЕССИЕЙ ФАКТОРА НЕКРОЗА ОПУХОЛЕЙ (TNF)
    • Друцкая М.С., Ефимов Г.А., Зварцев Р.В., Чащина А.А., Чудаков Д.М., Тиллиб С.В., Круглов А.А., Недоспасов С.А.
    • в журнале Биохимия, издательство ИКЦ «Академкнига» (Москва), том 79, с. 1648-1656
  • • 2011 Новая линия трансгенных репортерных мышей для изучения экспрессии фактора некроза опухолей
    • Кучмий А.А., Круглов А.А., Галимов А.Р., Шебзухов Ю.В., Чудаков Д.М., Лукьянов С.А., Недоспасов С.А.
    • в журнале Российский иммунологический журнал, издательство Наука (М.), том 5, № 3-4, с. 205-213
  • 
    • 2003 Chromophore environment provides clue to "Kindling Fluorescent Protein" riddle
    • Chudakov D.M., Feofanov A.V., Mudrik N.N., Lukyanov S., Lukyanov K.A.
    • в журнале Journal of Biological Chemistry, издательство American Society for Biochemistry and Molecular Biology Inc. (United States), том 278, № 9, с. 7215-7219

• Доклады на конференциях

  • • 2022 Comparison of clinical outcomes and inflammatory markers between patients with COVID-19 on Netakimab, Tocilizumab and Baricitinib treatment: a retrospective study (Устный)
    • Авторы: Bryushkova E.A., Skatova V.D., Mutovina Z.Y., Zagrebneva A., Fomina D.S., Strazhesko I.D., Akopyan A., Tkacheva O.N., Lysenko M.A., Chudakov D.M.
    • EAACI Hybrid Congress 2022, Прага, Чехия, 2 июля 2022
  • • 2022 Оптимизация условий антигенспецифического выращивания регуляторных Т-клеток периферической крови на модели цитомегаловирусной инфекции (Устный)
    • Авторы: Булахов А.Г., Брюшкова Е.А., Чудаков Д.М.
    • XXXIV зимняя молодежная научная школа "Перспективные направления физико-химической биологии и биотехнологии", Москва, Россия, 8-11 февраля 2022
  • • 2000 Молекулярный полиморфизм оомицетов: структурно-функциональные особенности и перспективы в систематике и филогении группы (Устный)
    • Авторы: Малеева Ю.В., Чудаков Д.М., Колесников А.А., Аджубей И.А., Яцентюк С.П.
    • Микология и криптогамная ботаника в России: традиции и современность / Международ. конф., Санкт-Петербург, 24-28апреля 2000 г., 2000

• Тезисы докладов

  • • 2021 A new method for simultaneous clonal profiling of B- and T-cells infiltrating the tumor microenvironment
    • Tkachenko V., Smirnova A., Snezhkina A., Kudryavtseva A., Lebedev Y., Chudakov D., Mamedov I., Komkov A.
    • в сборнике FEBS Open Bio, серия Suppl. 1, место издания Wiley, том 11, тезисы, с. 412-412 DOI
  • • 2021 Parallel high-throughput profiling of TRA, TRB, TRG, TRD, IGH, IGK, IGL repertoires using advanced unbiased multiplex PCR for clonality assessment in ALL
    • Komkov A., Miroshnichenkova A., Smirnova A., Volchkov E., Popov A., Olshanskaya Y., Lebedev Y., Maschan M., Chudakov D., Mamedov I.
    • в сборнике HemaSphere, том 5, тезисы, с. 125-125 DOI

• Руководство дипломными работами

  • • 2022 Investigating helper T cell plasticity in lung adenocarcinoma
    • Научные руководители: Чудаков Д.М., Брюшкова Е.А.
    • Автор: Булахов А.Г., (Магистр)